Содержание

можно ли, влияние на организм — CARHack.ru

Напряженные трудовые будни и стрессовые ситуации часто вынуждают водителей употреблять глицин за рулем. Врачи-специалисты рекомендую применять этот препарат в профилактических целях при частых эмоциональных нагрузках и нервных состояниях. Но как к использованию глицина водителями относится закон и как препарат влияет на физическое состояние человека? Разберем все эти нюансы подробнее.

Что такое глицин

Глицин — это медицинский препарат, который представляет собой аминокислоту. Аминокислота глицин относится к подвиду заменяемых, которые принимают участие во многих химических процессах в организме человека, протекающих ежесекундно.

Прием глицина помогает нормализовать повышенную эмоциональность и снять нервное напряжение. Рекомендуется препарат к применению в ситуациях, когда ожидается психологически тяжелое мероприятие.

В аптеках глицин продается в виде маленьких таблеток белого цвета, сладких на вкус. Как говорится в инструкции по применению, таблетки необходимо рассасывать для более эффективного действия препарата.

В организме человека глицин способствует более быстрому протеканию процесса метаболизма, что приводит к активации функций нервной системы и общему улучшению самочувствия и повышению концентрации.

Препарат разрешено принимать людям любого возраста для общего укрепления организма, формирования устойчивости к стрессу и повышению эффективности работы рецепторов. При приеме глицина исчезает чувство слабости и улучшаются физическое состояние организма. Человек чувствует себя более уверенным и сильным.

Глицину свойственно накапливаться в организме, поэтому принимают его курсом после обязательной консультации с лечащим терапевтом. Препарат обычно не вызывает никаких побочных эффектов, но применение без перерывов и в больших дозах могут вызвать:

  1. сонливость;
  2. аллергию.

Желательно не принимать глицин при пониженном давлении и наличии аллергии на составляющие вещества в препарате.

Глицин за рулем: что говорит закон

По закону глицин не относится к категории запрещенных препаратов. Водителю разрешено его принимать и за рулем и до поездки. Даже при остановке вашего автомобиля сотрудником службы ГИБДД, проверять употребляли ли вы глицин или нет никто не будет. Водитель может даже принять таблетку на глазах постового. Оштрафовать за прием глицина за рулем водителя нельзя. Дотошный сотрудник ГИБДД может, конечно, задержать вас и отправить ваши таблетки на экспертизу, но, когда выяснится, что это простой глицин, наказан будет он, а не вы.

В каких случаях лучше не принимать глицин за рулем

Несмотря на всю безопасность и полезность этой аминокислоты, в некоторых случаях водителю лучше воздержаться от приема глицина. Принимать препарат не стоит в случаях, если:

  1. у вас постоянно низкое давление или диагностирована гипотония;
  2. вы не выспались и находитесь в сонном состоянии;
  3. после приема глицина у вас наблюдается сильный седативный эффект и понижение концентрации;
  4. если накануне вечером вы употребляли алкоголь;
  5. если совместно с глицином вы принимаете какие-либо другие препараты успокоительного действия.

При возникновении сильной сонливости после приема глицина вы можете значительно утратить концентрацию за рулем и попасть в ДТП.

Так можно или нельзя глицин при вождении транспорта

Однозначно ответить на этот вопрос трудно, так как на отдельного человека препарат может повлиять по-разному. Законом он не запрещен, но все же принимать решение следует, исходя из особенностей организма.

Лучше всего начать курс глицина в те дни, когда никуда не нужно ехать, и посмотреть на реакцию организма. Реакция водителя за рулем должна быть постоянно на высоком уровне, поэтому нельзя допускать снижение концентрации. Но влияние стресса и повышенного давления на управление транспортом может быть еще хуже. В этом случае, если нет других проверенных альтернатив, то глицин принимать даже рекомендуется.

Вообще, глицин относится к тем препаратам, которые чаще рекомендуются к приему за рулем, чем запрещаются. Положительное воздействие этого препарата на психическое состояние может помочь справиться со стрессом во время обучения вождению, сдачи экзамена на права за рулем учебного автомобиля или же при первых поездках в собственном автотранспорте.

Особенно глицин рекомендуется водителям женского пола, так они больше подвержены стрессу при управлении автомобилем и чаще создают аварийные ситуации на дорогах чем водители-мужчины, согласно статистике. Кроме того, если женщина едет в машине с ребенком, который старше 3-х лет, то глицин можно и дать малышу, чтобы он не отвлекал маму от руля и принять самой.

Маленькие дети, особенно когда они едут в машине с мамой, которая из-за концентрации на дороге, не уделяет им должного внимания, могут нервничать и намерено отвлекать родителя на себя. Глицин поможет и маме и ребенку справиться с ситуацией.

Полезные советы водителям

Если вы решили начать принимать глицин, то сначала обязательно проконсультируйтесь с вашим врачом. Если доктор скажет, что при вашем здоровье глицин за рулем лучше не принимать, то обязательно прислушайтесь к его совету и спросите, какой альтернативный препарат он посоветует при ваших показаниях.

Если во время поездки вы сильно нервничаете и вас начинает кидать в жар или наблюдается легкий тремор в руках, то обязательно примите глицин, если он у вас есть с собой. При таком состоянии организма глицин точно не навредит, а, наоборот, поможет вам справиться с переживаниями.

Если за рулем вы не можете сконцентрироваться от того, что устали и очень хотите спать, то глицин принимать категорически нельзя. Лучше в таком случае совсем воздержаться от управления транспортом, воспользовавшись альтернативным вариантом.

успокоительное средство при вождении автомобиля

Глицин относится к препаратам широкого назначения и часто прописывается в комплексном лечении сердечно-сосудистых или неврологических заболеваний. Также, обладая антидепрессивным эффектом, это медикаментозное средство действует как успокоительное, снимая раздражение и нервозность. Именно поэтому многие люди пропивают курс глицина, в том числе и водители, которые часто чувствуют напряжение, вызванное ситуациями на дорогах. Однако, многие успокоительные препараты запрещены при вождении авто на законодательном уровне. Относится ли к ним глицин, рассмотрено в статье.

Глицин за рулём с точки зрения закона

Каждый водитель, садясь за руль машины, должен иметь острое зрение и хорошее самочувствие, а также обладать быстрой реакцией, что позволит быть бдительным и предельно внимательным на дорогах. Многие лекарственные препараты запрещены к употреблению непосредственно перед поездкой, что регулируется ст. 12.8 КоАП РФ.

Знаете ли вы? Молекулы глицина обнаружены учёными в составе космической пыли, что указывает на его внеземное происхождение.

Существует список медикаментов, которые запрещено употреблять водителям, часто ездящим на машине, — он представлен в Постановлении Правительства РФ № 681 от 30 июня 1998 г. К ним относятся снотворные и успокоительные препараты, которые, воздействуя на нервную систему, замедляют реакцию на непредвиденные ситуации, а также имеют побочные эффекты в виде повышенной сонливости, мышечной слабости, тумана перед глазами и прочее.

Самолечение может привести к ухудшению состояния здоровья, а потому перед началом приёма препарата рекомендуется проконсультироваться с врачом.

Что касается глицина, то вещество хоть и является успокоительным, обладает слабовыраженным моментальным эффектом, а его употребление предполагает длительный курс по специальной схеме. Поэтому в случае нормальных дозировок это лекарство никоим образом не сказывается на процессе вождения и, конечно, при тесте на алкоголь, не способно указать на содержание спирта или наркотика в крови.

Положительное и негативное влияние

Ввиду широкого спектра действия, который достигается с помощью содержания в составе аминокислоты, глицин показан при:

  • восстановлении после инсульта;
  • психоэмоциональных перегрузках и стрессах;
  • наличии патологий ЦНС;
  • снижении работы головного мозга, ухудшении памяти и обработки информации;
  • расстройствах отделов НС, отвечающих за функционирование внутренних органов;
  • снятии похмельного синдрома для улучшения общего состояния;
  • лечении черепно-мозговых травм;
  • развитии подросткового девиантного поведения;
  • лечении алкогольной зависимости в комплексной терапии.

Важно! Содержащаяся в составе аминокислота значительно снижает влечение к спиртным напиткам.

Препарат широко применяется в межсезонье, при перепадах температуры и давления, которые становятся причиной частых вегетативных расстройств, а также значительно понижает метеозависимость и вызванную ею бессонницу.

Положительные свойства:

  • ускорение обменных процессов в коре головного мозга;
  • успокоительное и антидепрессивное — смягчает раздражительность и агрессию;
  • повышение адаптации в социуме;
  • выработка «гормона счастья», улучшение состояния волос и ногтей;
  • значительное уменьшение интенсивности болевого синдрома при болезнях позвоночника;
  • нормализация уровня сахара в крови;
  • улучшение детоксикационной функции печени, которая отвечает за вывод токсинов из организма.

Аминокислота глицин является одной из пищевых добавок и соответствует Е-640. Её часто добавляют в продукты питания в качестве усилителя вкуса и запаха.

Несмотря на «мягкость» препарата, к его употреблению стоит отнестись с осторожностью людям, страдающим гипертонией (в процессе лечения необходим постоянный контроль давления), а также аллергикам (аминокислоты в редких случаях могут вызвать такие реакции, как сыпь, зуд или покраснения кожи). Также лекарство противопоказано женщинам на всех сроках беременности и кормящим.

Глицин нуждается в дозировке, нарушение которой может стать причиной вялости, сонливости и быстрой утомляемости. При избытке глицина могут наблюдаться частое сердцебиение и аллергическая реакция.

Рекомендуем для прочтения:

Допустимая дозировка

Согласно инструкции, глицин можно принимать следующим образом:

  1. Психическое напряжение, ухудшение памяти, снижение концентрации, умственной способности и развития, девиантные формы поведения корректируются дозировкой — детям, подросткам и взрослым назначают по 1 табл. 2–3 раза в день. Курс составляет от 14 до 30 дней.
  2. Функциональные и органические поражения ЦНС, которые сопровождаются повышенной степенью возбудимости, эмоциональным раздражением, бессонницей — дети до 3 лет принимают по 50 мг (1/2 табл.) от 2 до 3 раза в день на протяжении 7–10 дней, последующий курс составляет то же количество дней и ту же дозировку, но с уменьшением количества приёмов до 1 раза в день. В случае необходимости, продолжительность курса может быть увеличена до 30 дней, а также возможен повтор через месяц.
  3. Бессонница — 1/2 или 1 целая табл., в зависимости от возраста пациента, принимается за 20–30 мин. до сна (также допускается выпить лекарство сразу перед сном.
  4. Ишемический инсульт — 10 табл., которые составляют 1000 мг препарата измельчаются до состояния порошка и принимаются с 1 ч. ложкой воды в течение первых 3 ч. непосредственно после того как случился инсульт. В дальнейшем — та же дозировка рассчитывается на 1 сутки (курс длится 1–5 дней) и после — от 1 до 2 табл. 3 раза в сутки на протяжении месяца.
  5. В процессе лечения наркологической зависимости, для снятия психоэмоционального напряжения и стимуляции умственной работоспособности — 1 табл. не более 2–3 раз в день (курс длится от 14 до 30 дней и может повторяться до 6 раз в год).

Когда лучше воздержаться от приёма средства

Несмотря на то, что глицин не действует моментально, а имеет эффект только в процессе прохождения курса, существуют некоторые ситуации, при которых водителям лучше воздержаться от принятия этого средства. Например, это плохое самочувствие, которое возникает при простудных заболеваниях. Объясняется просто — организм, который и так требует отдыха, усилит действие глицина, что может привести к состоянию сонливости и потери реакции.

Также важно учитывать взаимодействие глицина с другими лекарствами, а именно его способность усиливать действие противосудорожных или снотворных препаратов — комбинирование этих средств может также привести к плохому самочувствию водителя. Важным правилом принятия глицина при частых поездках за рулём автомобиля является то, что пить его допускается только вечером, а не утром.

Являясь эффективным средством в борьбе со стрессами и неврозами, глицин широко применяется как детьми, так и взрослыми. Однако, благодаря мягкому воздействию и отсутствию запрещённых законодательством составляющих в составе, вполне допустим в качестве успокоительного лекарства и для водителей. Всё же, не стоит забывать о возможности передозировки и не отклоняться от назначенной схемы лечения.

Подписывайтесь на наши ленты в таких социальных сетях как, Facebook, Вконтакте, Instagram, Pinterest, Yandex Zen, Twitter и Telegram: все самые интересные автомобильные события собранные в одном месте.

Какие лекарства нельзя принимать водителям за рулем рассказали в управлении ГИБДД МВД по Карачаево-Черкесии

27 ФЕВРАЛЯ. ЧЕРКЕССК. Некоторые лекарственные средства запрещены к применению перед вождением автомобиля, поскольку оказывают влияние на психику и нервную систему человека. Об этом корреспонденту РИА «Карачаево-Черкесия» рассказали в управлении ГИБДД МВД по КЧР.

Некоторые препараты снижают концентрацию внимания и затормаживают нейрофизиологические реакции, что увеличивает риск попадания в ДТП.  В связи с этим, Управление  ГИБДД МВД по КЧР рекомендует не употреблять перед тем, как сесть за руль  лекарственные препараты, содержащие спирт, или же препараты, которые проявляют такие побочные эффекты, как головокружение, снижение остроты зрения, зрительные галлюцинации, т.е. препараты в составе, которых присутствуют психотропные и наркотические вещества.

К первой категории лекарственных препаратов, запрещенных перед вождением, относят транквилизаторы, которые вызывают сонливость, заторможенность, мышечную слабость, замедление реакции — это глицин, реланиум, тазепам, радодерм, элениум, фенибут.

Ко второй категории можно отнести антидепрессанты, которые вызывают эмоциональное возбуждение, нарушение восприятия и координации движении — это доксепин, тразодон, амитриптилин.

К третьей категории относят психостимуляторы, которые приводят нервную систему человека в заторможенное состояние, а при увеличении дозы наоборот оказывают эмоциональное возбуждение — это кофеин, никотин, эфедрин, морфин, кодеин.

Четвёртая категория это нейролептики, они также приводят человека в заторможенное состояние либо наоборот вызывает расторможенность — это аминазин, френолог, галоперидол, тизерцин, финлепсин, карбамазепин, трамадол.

В пятой категории содержатся анальгетики (обезболивающие), вызывают вялость, тошноту, нарушение моторики, сонливость — это пенталгин, темпалгин, спазмалгон, салпадеин, мигрень.

К шестой категории относятся антигистаминные(противоаллергические), вызывают вялость, сонливость, заторможенность реакции — это димедрол, кларитин, супрастин, тавегил, лоратадин, телфаст, лимитна, кутотифен, цетиризин.

Седьмая категория включает в себя противопростудные препараты, которые также вызывают сонливость, вялость,  тошноту — это колодезем, терафлю, фервекс, солутан, кодтерпин.

К восьмой категории относят гипотензивные (понижающие артериальное давление), они снижают реакцию, вызывают рассеянность, вялость, слабость — это атенолол, атенолан, адельфан, тенормил, клофелин, синопрекс, кристепин, бринердин, налипал.

Девятая категория включает в себя препараты для ЖКТ. Такие препараты ухудшают зрение — это гастрозем, гастрил, пирен, настройками, ранитидин.

Десятая заключающаяся категория включает в себя капли, которые подразделяется на 2 группы: сердечные и глазные.

Сердечные — это капли, которые содержат этиловый спирт — валосердин, валокордин, корвалол, боярышник, пустырник, валериана, красный перец, поскольку они приводят организм человека в заторможенное состояние.

Глазные — это капли содержащие атропин, так как они очень сильно ухудшают зрение.

Кроме того, старший государственный инспектор Управления ГИБДД МВД по Карачаево-Черкесской Республике Ибрахим Токов рассказал корреспонденту РИА «Карачаево-Черкесия», что наличие в крови препаратов, содержащих спиртовой состав и препаратов, которые могут показать положительный результат на наличие наркотических средств в организме при химико-токсикологическом анализе,служит основанием оформления протокола и передачи дела в суд.

 

какие безопасны, а какие не очень — журнал За рулем

Вопрос, пить или не пить, когда речь идет о вождении автомобиля, просто не стоит. Конечно, не пить — если речь об алкоголе. А лекарства? Многие из них также весьма опасны, о чем многие либо не подозревают, либо беспечно забывают.

На вопросы читателей отвечает Илья Пименов, эксперт журнала «За рулем».

На вопросы читателей отвечает Илья Пименов, эксперт журнала «За рулем».

Материалы по теме

Вопрос: Моя подруга — аллергик и часто принимает димедрол, в том числе за рулем автомобиля. Однажды, заметив ее заторможенную реакцию, я «отстранил» ее от управления машиной. Скажите, пожалуйста, насколько опасен или безопасен для водителей этот лекарственный препарат. (Константин)

Ответ: Димедрол — сильнодействующий антигистаминный препарат, его прием может вызывать сонливость, нарушение координации движения, повышенную нервозность. Понятно, что все это вождению отнюдь не способствует.

Кстати, пункт 2.7 ПДД прямо запрещает управлять автомобилем не только в состоянии алкогольного или наркотического опьянения, но и под воздействием лекарственных препаратов, ухудшающих реакцию и внимание, в болезненном и утомленном состоянии. Так что «отстранение» от управления было оправдано не только с моральной, но и с правовой точки зрения. К сильнодействующим лекарствам, вызывающим сонливость, могут быть отнесены и прочие антигистаминные (противоаллергические) препараты.

Материалы по теме

Вопрос: С утра поехал к стоматологу, который удалил мне зуб, сделав местное обезболивание ультракаином. Выйдя от врача, я сел за руль, но почувствовал тошноту и головокружение и вынужден был оставить машину до вечера. За несколько дней до похода к стоматологу я начал принимать афобазол, чтобы снять тревожность (боюсь зубных врачей с детства). Может ли реакция моего организма быть ответом на совместный прием этих препаратов? И как можно без боязни сесть за руль после похода к стоматологу? (Семен)

Ответ: Применение любого анестетика может вызвать реакцию, подобную описанной вами — тем более в сочетании с другими лекарственными средствами. Так что после применения анестезии за руль лучше все-таки не садиться хотя бы пару часов. Сам по себе афобазол, обладая успокаивающим действием, сонливости и тошноты не вызывает и вождению не вредит, в отличие от корвалола, валокордина, настоек пустырника, валерианы, которые многие применяют с той же — успокаивающей — целью. При этом тест на наркотические вещества покажет наличие в организме барбитуратов — психотропных средств. После приема перечисленных лекарств садиться за руль можно только на третьи сутки!

В следующий раз, отправляясь лечить зубы, постарайтесь (при возможности) не ехать на своей машине, воспользуйтесь такси или общественным транспортом.

Материалы по теме

Вопрос: Болею ОРВИ, которые переходят в бактериальные инфекции. Приходится принимать антибиотики (кларитромицин, амоксиклав и т.п.). Побочных действий, влияющих на внимание и реакцию, от них не замечал. Вопросы:

1. В инструкции нет прямых указаний на влияние на управление транспортными средствами и механизмами. Как эти препараты влияют на это и можно их применять при вождении?

2. Содержат ли антибиотики запрещенные вещества?

3. Через какое время после окончания курса лечения можно управлять автомобилем?

C уважением, Петр

Ответ: Производители кларитромицина указывают, что препарат может вызывать нарушение сна, головокружение, шум в ушах, даже галлюцинации. Амоксиклав в ряде случаев вызывает тошноту, беспричинную тревогу, сильную головную боль, неадекватность поведения, приступы агрессии, туманность сознания, замедленную реакцию. Все это также явно не способствует нормальному вождению и ведет к нарушению того же пункта 2.7 ПДД. Впрочем, при правильном подборе дозировки такой реакции организма может и не быть. Прямого запрета на употребление указанных препаратов водителями нет. А абсолютно здоровых людей, как известно, не бывает. Полностью указанные препараты выводятся из организма в течение суток. Но это лишь ориентировочная информация. Точную способен дать ваш лечащий врач. Обязательно проконсультируйтесь с ним на тему вождения автомобиля.

Материалы по теме

Вопрос: Принимаю лекарства от астмы — аэрозоли бекламетазон, беродуал. Схема лечения — 4 раза в сутки. В основе аэрозоли — этиловый спирт, который оседает в ротовой полости, поступает в ЖКТ. Насколько устойчивы пары этанола в легких, в ротовой полости? Какой период необходимо выдержать после ингаляции, чтобы алкотестер не реагировал? Отражается ли на наличии этанола в крови такой прием лекарств?

С уважением, Дмитрий

Ответ: И вам мы настоятельно рекомендуем проконсультироваться с лечащим врачом по поводу применения перечисленных препаратов при вождении. Однако понятно, что лекарства на спиртовой основе более опасны для водителей из-за возможного алкогольного фона. Запах от водителя в сочетании с возбужденностью или заторможенностью спровоцирует инспектора ДПС отправить вас на проверку к наркологу. Впрочем, даже при регулярном приеме указанных препаратов вы вряд ли дотянете до 0,35 промилле в крови. И на всякий случай рекомендуем вам запастись справкой, что вы принимаете лекарства от астмы.

Материалы по теме

Вопрос: Добрый день.

Не единожды слышал, что за кондитерский мак в булочке, если сдавать анализы при медосвидетельствовании, могут вас признать наркоманом, употребляющим опий, с соответствующими последствиями, да еще и поставят в на учет в наркодиспансер. Так ли это? Каков срок выведения кондитерского мака из организма? Спрашиваю, так как люблю различную магазинную выпечку, и порой, читая состав, вижу, что «возможно наличие кондитерского мака» в булочке, в которой его вроде и нет, и быть-то не должно. (Алексей)

Ответ: Действительно, тесты на наркотики весьма чувствительны и могут обнаружить употребление героина через 4 дня, каннабиоидов — через 5 дней. А при систематическом приеме — и через несколько недель после прекращения употребления (если такое встречается). Кондитерский мак может оставить в организме следы морфина, которые сохраняются до 8–12 часов после употребления. И этого будет достаточно, чтобы зафиксировать наркотическое опьянение у водителя! Так что булочки с маком лучше не употреблять ни в день поездки за рулем, ни накануне. А если вы ездите на машине ежедневно — отказаться от подобной выпечки во избежание неприятностей.

Рекомендации ЗР

Всем водителям рекомендуем держать под рукой список препаратов, которые чаще всего обнаруживают в крови водителей при исследовании в токсикологических лабораториях. И при приеме лекарств не только внимательно читать инструкцию, особенно про побочные действия, но и сверять состав препарата с нашим списком. При совпадении придется выбирать либо руль, либо лекарство.

Лекарства, которые нельзя употреблять перед тем, как сесть за руль:

  1. Фенобарбитал (входит примерно в 200 наименований лекарств)
  2. Феназепам
  3. Доксиламин (донормил)
  4. Прегабалин (лирика)
  5. Трамадол (трамал, залдиар)
  6. Карбамазепин (финлепсин)
  7. Кодеинсодержащие препараты (примерно 50 наименований, содержащих кодеин).
  8. Димедрол
  9. Дицикловерин (Триган-Д)
  10. Декстрометорфан
  11. Амитриптилин
  12. Налбуфин
  13. Буторфанол (Стадол)
  14. Тианептин (Коаксил)
  15. Баклофен
  16. Амантадин
  17. Хлорпротиксен
  18. Габапентин
  19. Галоперидол
  20. Мексидол
  21. Миртазапин
  22. Флупиртин (катадолон)
  23. Аминазин
  24. Тиоридазин
  25. Клопиксол
  26. Селегилин
  27. Ламотриджин
  28. Мапротилин
  29. Кветиапин (сероквель)
  30. Циталопрам
  31. Циклодол
  32. Фенибут
  33. Карфедон (фенотропил, метаболит — фенибут)

P.S. Редакция «За рулем» благодарит вас за проявленный интерес. Диалог с нашими экспертами будет продолжен.

Можно ли пить за рулем

Содержимое статьи:

Как известно, пить спиртные напитки за рулем крайне опасно, потому что это может стать причиной аварии, да и сотрудники ГИБДД не одобрят такой поступок и обязательно оштрафуют. Но, помимо спиртного, существует немало других напитков, а так же лекарств, которые так же нежелательно принимать перед тем, как садиться за руль своего автомобиля.

Какие лекарственные препараты нельзя пить за рулем автомобиля

Поскольку, сидя за рулем авто, водитель должен обладать особенно острым зрением, предельной внимательностью, быстротой скорости реакции, он должен понимать, что не все из лекарственных препаратов он может пить перед тем, как отправиться в поездку. Даже если лекарство не содержит спирта или содержит его минимальную дозу, важно внимательно прочитать инструкцию и особое внимание уделить моменту возможности вождения автомобиля после того.

Существует список лекарственных препаратов, запрещенных для употребления перед тем, как сесть за руль своей машины. К таковым относятся снотворные, успокоительные, которые содержат вещества, оказывающие определенное воздействие на нервную систему, вызывающие сонливость, уменьшение скорости реакции.

Если автомобилист уже сидит за рулем, нежелательно (как и до этого момента) принимать любые сильнодействующие успокоительные, а в особенности те, которые выпускают по рецепту врача (невропатолога, психиатра). Воздействуя расслабляющее на нервную систему, они способны привести к тому, что водитель не сможет правильно сориентироваться в определенной ситуации, требующей максимальной внимательности и особой скорости реакции – не сможет вовремя нажать на тормоз или повернуть в нужном направлении. Особенно это опасно на узких дорогах и в условиях города.

Некоторые лекарственные препараты вызывают такие побочные явления, как повышенная сонливость, туман перед глазами, нечеткость изображения, мышечная слабость. Это очень опасные состояния, которых требуется избегать во время вождения. Прием корвалола не влияет на показатели количества спирта в организме, поскольку такое лекарство содержит слишком небольшую дозу спирта. В небольших дозах он не опасен и не может навредить водителю, но важно не превышать самую маленькую дозировку (до 15 капель).

Следует учитывать и такой момент, как особенность организма. В некоторых случаях такое лекарство может оказывать сильное седативное действие, тогда лучше воздержаться от приема каких-либо лекарств за рулем. То же касается и пустырника. Настойки предполагают наличие спирта, поэтому лучше принимать их только после того, как поездка будет завершена, лучше перед сном.

Для того, чтобы избежать проблем с инспектором ГАИ, лучше вообще не принимать никаких лекарств за рулем. Даже бокал кваса может привести к тому, что инспектор с помощью специального прибора вычислит количество спирта в крови водителя.

Что касается глицина, этот препарат имеет слабое моментальное действие и предполагает длительный прием, поэтому никаким образом (при нормальных небольших дозах) не скажется на процессе вождения и тем более не повлияет отрицательно на результат определения количества спирта в крови.

Афобозол относится к седативным препаратам, которые лучше всего принимать на ночь или в небольших дозах в течение дня. Если принимать по одной – две таблетки, особого вреда для водителя не будет. Здесь так же важно определить свою чувствительность к такому препарату. Если возникает сонливость, лучше отказаться от его употреблении за рулем авто.

Можно ли пить за рулем в Америке, Греции, Испании, Италии?

Обычно в большинстве стран мира запрещено за рулем употреблять спиртные напитки и сильнодействующие успокоительные препараты. Но если выпита небольшая доза вина или пива, это не станет поводом для штрафов со стороны правоохранительных органов. Большие дозы запрещены, так как это представляет собой серьезную угрозу для окружающих и для самого автомобилиста.

Существует ряд стран, в которых строго-настрого запрещено пить даже маленькие дозы спиртного. Это Бразилия, Саудовская Аравия, Венгрия, Румыния и Словакия. Если в одной из этих стран водитель выпьет хоть каплю спиртного, ему будут грозить большие неприятности.  Для Испании, Италии, Греции и других стран принята определенная допустимая доза спиртного, не превышающая – от 0.3 до 0.5 промилле. В Америке можно немного разгуляться в это плане, допустимая доза промилле – до 0.8.

Можно ли пить за рулем в припаркованной машине

Пить спиртное за рулем запрещено. Но если машина уже припаркована и водитель не собирается снова отправляться в путешествие, он может позволить  себе слабость выпить любимый напиток, содержащий спирт. Однако во избежание проблем с правоохранительными органами рекомендуется при этом сесть на заднее сидение машины.

Предельная осторожность всегда оказывает хорошую услугу, поэтому лучше всего постараться не идти вразрез с общепринятыми правилами и законами. Это позволит в дальнейшем не сталкиваться с неприятными ситуациями, когда инспекторы ГИБДД требуют штрафов. Так же важно стремиться всегда быть бодрым за рулем, чтобы вовремя выполнить то или иное действие на дорогах.

Видео: можно ли пить за рулем

Штраф за лекарство в крови: специалисты прокомментировали очередную инициативу ГИБДД

ГИБДД планирует приравнять некоторые лекарства к алкоголю и наркотикам. Водителей, в крови которых обнаружат попавшие под запрет вещества, будут привлекать к административной ответственности за пьяную езду. «ВМ» узнала мнение экспертов по данному вопросу. 

Председатель межрегионального профсоюза работников общественного транспорта «Таксист» Ярослав Щербинин считает, что эта мера не окажет заметного эффекта.

— По сравнению с теми, кто попал в аварию из-за пьяного вождения, доля тех, кто изменил поведение из-за лекарств и их побочных эффектов, несравнимо мала. Это не основная проблема, которая влияет на безопасность. Да, сколько-то человек может и опасны за рулем под воздействием препаратов, но явно не столько, чтобы стоило это проводить отдельным актом.

Список запретных для водителей лекарств хотят отдать на разработку специалистам Минздрава. «ВМ» узнала, какие вещества могут туда попасть.

— Диапазон лекарств, которые могут запретить, на самом деле достаточно широк, — объяснила фармацевт Елена Купцова. — На ум сразу приходят снотворные и успокоительные средства, которые ухудшают концентрацию внимания и скорость реакции, но есть и другие лекарства с похожим побочным действием. Конечно, эти эффекты могут и не проявиться, тут все зависит от дозировки и индивидуальной восприимчивости пациента.

Специалист рассказала, какие конкретно лекарства обладают эффектом, затрудняющим вождение автомобиля.

Мидокалм, Сердолут

Эти лекарства относятся к классу миорелаксантов – веществ, снимающих спазмы мышц. Их применяют для реабилитации после травм, нарушении мозгового кровообращения и остеохондрозе. Проблема миорелаксантов в том, что они обладают центральным действием, то есть поступают прямо в мозг и заставляют его подавать сигналы в мышцы, чтобы они расслабились. Поэтому у употребляющего их человека расслабляются не только те мышцы, которые вызывают болевой синдром, но и все остальные. В таком состоянии за руль лучше не садиться, поскольку есть опасность не успеть среагировать и попасть в аварию.

Терафлю, Фервекс

Вещества на основе парацетамола, снимающие симптомы простуды. В последнее время они стали популярны у тех, кому нужно быстро избавиться от проявлений болезни и восстановить работоспособность. Производитель сообщает, что эти лекарства не вызывают сонливости, но это тот случай, когда все зависит от чувствительности организма пациента к компонентам препарата. Если вы не уверены, что не начнете засыпать за рулем после такого лечения, лучше воздержитесь от вождения в день приема.

Супрастин

Мощное противоаллергенное средство,. Обладает центральным действием, блокируя не только аллергическую реакцию, но и мыслительные процессы в мозге, замедляя скорость обработки информации и принятия решений. Как, впрочем, и другие антигистаминные препараты. Вождение требует концентрации внимания и оперативных действий, так что за руль при лечении аллергии лучше не садиться.

Темпалгин, Ибупрофен, комбинированные анальгетики:

Эти препараты обладают болеутоляющим и противовоспалительным действием, но также действуют на центральную нервную систему. За избавление от боли приходится платить снижением скорости реакции и концентрации внимания, что не лучшим образом влияет на безопасность вождения.

Глицин

Глицин – довольно популярное средство среди тех, кто нуждается в улучшении мозговой деятельности, особенно часто его употребляют студенты и те, кто страдает ухудшением памяти. Но на некоторых этот препарат действует как снотворное. А сон за рулем – явно не то, что вам нужно.

Бронхолитин

Это и другие эфедринсодержащие средства против простуды, помимо основного действия, здорово влияют на организм, вызывая сонливость и замедление реакций. Перед вождением этот препарат принимать не стоит.

— В этот список, скорее всего, попадут многие успокоительные, — добавила фармацевт. – Но те, кто нервничает за рулем, без лекарств не останутся, поскольку существуют неспиртовые успокаивающие настои – например, пустырника, — и не вызывающие сонливости средства, такие как Афобазол.

На фото: фармацевт Замира Бекузарова и москвичка Мария Артюхина / Фото: Светлана Колоскова, «Вечерняя Москва»

КОММЕНТАРИЙ ЭКСПЕРТА

Елена Неволина, руководитель Аптечной Гильдии:

К каждому лекарственному препарату производитель прикладывает инструкцию по применению, и в ней есть такой раздел, как «применять с предосторожностью». И обязательно присутствует упоминание о том, что вещество нежелательно употреблять при вождении транспортного средства и в других ситуациях. Производитель сам предупреждает потребителя об опасности лекарственного препарата. Инициатива ГИБДД мне кажется излишней, поскольку здесь достаточно репутационной ответственности производителя. Если окажется, что водитель употребил лекарственное средство и попал из-за этого в аварию, а там не было инструкции о том, что применять его необходимо с предосторожностью, то это будет огромный вред репутации фармкомпании, этого стараются избегать.

ЕЩЕ ПО ТЕМЕ

Какие еще нововведения ждут водителей:

Новые требования к ПТС

Согласно информации, которую ГИБДД разместила на портале regulation.gov.ru, в августе 2019 года будут установлены новые требования к свидетельствам о регистрации транспортных средств и ПТС. Дополнительно к уже  существующему бумажному формату этих документов, появится возможность оформить пластиковое свидетельство о регистрации, в которое будет встроен чип. Изменениям подвергнется и содержание этих свидетельств: в документах появится раздел о дополнительной маркировке транспортного средства. Также будет уменьшен физический размер свидетельств.

На учет, не отходя от кассы

С августа 2019 года получить госномер можно будет прямо в автосалоне. Регистрацией автомобилей по прежнему будет заниматься ГИБДД, а вот номера смогут выдавать любые уполномоченные ведомством организации, в том числе дилеры и производители.

Упростить экзамен

Сдать на права станет проще: этапы «площадки» и «города» будут объединены, а из программы экзамена исключат некоторые упражнения – например, «змейку», подъем на эстакаду и въезд в бокс задним ходом. Правда, эксперты считают, что из-за того может увеличиться количество мелких аварий.

Поделиться в FBПоделиться в VKПоделиться в TWПоделиться в OK

ᐅ Биотредин таб. подъязыч. №30 отзывы — 13 честных отзыва покупателей о Средства для борьбы с вредными привычками Биотредин таб. подъязыч. №30

Самые выгодные предложения по Биотредин таб. подъязыч. №30

 
 

Имя скрыто, 26.05.2020

Комментарий: Хорошее средство для уменьшения влечения к алкоголю.

Lil Mama, 14.05.2020

Комментарий: Препарат нейтрализует снижение умственной работоспособности и концентрации внимания. Действие наступает быстро — минут ч/з 20 после приёма, но лучше пить курсами.

Запивать таблеточку не требуется, нужно просто положить её под язык. Упаковку из 30 таблеток покупала за 150 с чем-то р. Демократичная цена.

Имя скрыто, 13.04.2020

Комментарий: Очень действенный таблетки для повседневной жизни, успокаивают.Принимаю в основном за рулём, чтобы меньше обращать на дураков!!)

Имя скрыто, 26.12.2019

Комментарий: Достоинства:
действительно помогают.

Недостатки:
не выявил.

помогают что бы не бухать.

Диман Б., 11.12.2019

Комментарий: Неплохой вариант для борьбы со стрессами. Проверил на себе во время карантина. Побочных действий не заметил.

Имя скрыто, 20.11.2019

Комментарий: Пока что хороший результат, принимаю вместе с глицином

Влада Н., 06.11.2019

Комментарий: Сейчас принимаю биотредин. Даже муж заметил изменения, говорит, что стала позитивной и не нервничаю по поводу и без. Лично по моим ощущениям, помимо того, что меньше стрессую, так еще и стала более активной — и на работе, и дома всё успеваю, остаются силы и время с ребенком уроки учить.

Имя скрыто, 02.09.2019

Комментарий: Достоинства:
Уменьшает психоэмоцианальное напряжение!)

Недостатки:
Нету недостатков:)

Улучшает память)

Имя скрыто, 25.08.2019

Достоинства: Успокаивает,улучшает настроение,меньше ругаю мужа и детей))Стала активнее,меньше сплю.Но самое главное-препарат напрочь убивает аппетит)Не знаю,почему на меня он так действует,но мне нравится. А то похудеть после родов в мои 36 лет очень было сложно.

Недостатки: Дороговато обходится,потому что в день приходится пить 10-12 таблеток.А в упаковке их всего 30…

Имя скрыто, 25.08.2019

Комментарий: Достоинства:
Нормальный такой

Всё хорошо

 

Вера Л., 14.07.2019

Комментарий: Продаётся по адекватной цене. Помогает стабилизировать эмоциональный настрой, нейтрализует панику, помогает собраться вовремя, активизировать ресурсы интеллекта и памяти. Очень нужное дело, когда работаешь дистанционно, но по строгому графику, установленному ещё в офисе.

Имя скрыто, 15.05.2019

Достоинства: Эффективное средство для смягчение стрессовых ситуаций, неизбежных, если почти целыми днями никуда из квартиры не вылезаешь

Недостатки: Редко бывает в ближайшей аптеке. Раньше брала на Беру! Но сейчас и тут распродали((

Имя скрыто, 03.02.2019

Комментарий: Достоинства:
Удобная лекарственная форма, не дорого, эффективно, отличная комбинация действующих веществ

Недостатки:
Не обнаружено
Отличное средство, не дорого, помогает при стрессе

Нормативный контекст способствует сохранению аптамеров глицинового рибопереключателя

Abstract

По сравнению с последовательностями, кодирующими белок, влияние мутации и естественного отбора на последовательность и функцию некодирующих (нкРНК) генов изучено недостаточно. Многие гены нкРНК узко распространены только среди нескольких организмов и, по-видимому, быстро эволюционируют. По сравнению с последовательностями, кодирующими белок, существует множество проблем, связанных с оценкой нкРНК, которые не решаются с помощью традиционных филогенетических подходов, в том числе: короткая длина последовательности, отсутствие консервативности первичной последовательности и важность вторичной структуры для биологической функции.Рибопереключатели — это структурированные нкРНК, которые напрямую взаимодействуют с небольшими молекулами, чтобы регулировать экспрессию генов у бактерий. Обычно они состоят из лиганд-связывающего домена (аптамера), изменения укладки которого приводят к изменениям экспрессии генов. Рибопереключатель глицина является одним из наиболее хорошо изученных из-за широко распространенного тандемного расположения аптамеров (тандем), при котором два гомологичных аптамера взаимодействуют с глицином и друг с другом для регулирования экспрессии генов. Однако значительная часть глициновых рибопереключателей состоит из одиночных аптамеров (синглетонов).Здесь мы используем кластеризацию графов, чтобы обойти ограничения традиционного филогенетического анализа при изучении взаимосвязи между тандемными и одноэлементными глициновыми аптамерами. Кластеризация графов позволяет использовать более широкий спектр мер попарного сравнения для оценки сходства аптамеров. Используя этот подход, мы показываем, что один аптамер из пары тандемных глициновых рибопереключателей обычно гораздо более консервативен, и то, какой аптамер является консервативным, зависит от регулируемого гена. Кроме того, наш анализ также показывает, что одиночные аптамеры больше похожи на первый или второй тандемный аптамер, опять же на основе регулируемого гена.Взятые вместе, наши результаты предполагают, что тандемные глициновые рибопереключатели распадаются на функциональные синглтоны, при этом регулируемый (ые) ген (ы) диктует, какой глицин-связывающий аптамер является консервативным.

Информация об авторе

Рибопереключатель глицина — это нкРНК, отвечающая за регуляцию нескольких различных наборов генов у бактерий, которые обнаруживаются с одним (одиночным) или двумя (тандемными) аптаперами, каждый из которых непосредственно воспринимает глицин. Какой аптамер более важен для генной регуляции, а также функциональные различия между тандемными и одиночными аптаперами — давние вопросы в области рибопереключателей.Как и многие биологически функциональные РНК, глициновые аптамеры требуют специфической трехмерной складчатой ​​конформации. Таким образом, они имеют низкое сходство первичных последовательностей между отдаленно родственными гомологами и большие изменения в длине последовательности, которые затрудняют создание и анализ точных множественных выравниваний последовательностей. Чтобы лучше понять взаимосвязь между тандемными и одноэлементными аптамерами, мы использовали подход кластеризации графов, который позволяет нам сравнивать сходство аптамеров с использованием показателей, которые измеряют сходство как последовательностей, так и структур.Наше исследование показывает, что в тандемных глициновых рибопереключателях один аптамер более консервативен, чем другой, и какой аптамер является консервативным, зависит от того, какие гены регулируются. Более того, мы обнаружили, что многие одноточечные глициновые рибопереключатели, вероятно, происходят от тандемных рибопереключателей, в которых сайт связывания лиганда неконсервативного аптамера со временем деградировал.

Образец цитирования: Crum M, Ram-Mohan N, Meyer MM (2019) Нормативный контекст стимулирует сохранение аптамеров глициновых рибопереключателей.PLoS Comput Biol 15 (12): e1007564. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564

Редактор: Ши-Цзе Чен, Университет Миссури, США

Поступила: 4 сентября 2019 г .; Принята к печати: 25 ноября 2019 г .; Опубликован: 20 декабря 2019 г.

Авторские права: © 2019 Crum et al. Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License, которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе при условии указания автора и источника.

Доступность данных: Все данные были собраны из общедоступных данных, а образцы последовательностей, использованные в анализе, представлены во вспомогательной информации.

Финансирование: Эта работа частично финансируется Национальным научным фондом: MCB 1715440 (https://www.nsf.gov/) и Национальными институтами здравоохранения: GM115931 (https://www.nih.gov). /). Финансирующие организации не играли никакой роли в дизайне исследования, анализе данных, решении опубликовать или подготовке рукописи.

Конкурирующие интересы: Авторы заявили об отсутствии конкурирующих интересов.

Введение

Структурированные мотивы РНК играют жизненно важную роль во всех царствах жизни. Они необходимы для трансляции белков [1,2], выполняют каталитические функции [3,4] и регулируют экспрессию генов [5,6]. Понимание эволюции и сохранения структурированных РНК дает представление о клеточных процессах, в которых они участвуют. Однако, по сравнению с последовательностями, кодирующими белок, влияние мутации и естественного отбора на последовательность и функцию структурированных РНК недостаточно изучено.Некоторые РНК, такие как рибосомная РНК и другие большие функциональные РНК, широко распространены по целым царствам. Однако многие другие распространены узко, лишь у нескольких организмов, что позволяет предположить, что их эволюция может быть довольно быстрой [7,8].

Способность традиционных филогенетических подходов исследовать эволюцию структурированных РНК часто недостаточна из-за того, что они полагаются только на информацию о первичных последовательностях. В настоящее время только RAxML предоставляет алгоритм для филогенетического анализа, который принимает во внимание вторичную структуру, но он полагается на согласованную вторичную структуру, полученную после выравнивания последовательностей [9].Хотя это преимущество перед программным обеспечением, которое полагается исключительно на первичную последовательность, это все же устраняет возможность тонкого структурного сходства, которое может присутствовать в случае попарной оценки структурного сходства. Более того, антагонистическая роль, которую уменьшение длины последовательности и увеличение таксономического разнообразия играет на филогенетическую достоверность, ограничивает исследования многих регуляторов структурированной РНК, которые имеют тенденцию быть короткими и имеют высокое разнообразие первичных последовательностей [10].

Чтобы преодолеть эти проблемы, мы использовали кластеризацию графов, в которой каждая вершина соответствует последовательности РНК, а ребра взвешиваются на основе метрики расстояния (например,грамм. Структурное сходство РНК, сходство последовательностей или некоторая их комбинация), чтобы оценить относительное сходство родственных РНК. Метод кластеризации на основе графов недавно был использован для кластеризации контигов, принадлежащих одним и тем же транскриптам, в анализе транскриптома de novo [11], но в нем отсутствует структурный компонент, необходимый для точной кластеризации последовательностей структурированных нкРНК. Другие подходы к обнаружению и кластеризации структурированных РНК предоставляют исследователям надежные методы для классификации членов существующих семейств РНК [12-19] и идентификации новых структурированных нкРНК [20-25].Однако эти инструменты принципиально не предназначены для сравнения степеней консервативности кластеров гомологичных структурированных РНК.

Для исследования дивергенции мотивов необходим подход к анализу, который обеспечивает мелкомасштабное сравнение сходства внутри и между группами гомологичных РНК. Наш подход позволяет использовать любую меру попарного сходства между двумя последовательностями РНК для сравнения и исследования относительной консервации между группами. Таким образом, меры, которые включают чисто вторичную информацию о структуре [26,27], чисто информацию о последовательности [28,29] или их комбинацию [30–34], могут быть использованы так, чтобы вся доступная информация могла быть захвачена.Хотя этот подход не дает таких же выводов относительно линии происхождения, как традиционные филогенетические подходы, он позволяет учитывать гораздо больше переменных при оценке сходства нкРНК.

Регуляторные РНК

быстро стали крупнейшим классом функциональных РНК. Тем не менее, наше понимание их эволюции отстает от более крупных каталитических РНК, таких как рибосома. Одним из классов регуляторных РНК, которые, как и рибосома, берут свои функции из трехмерной структуры, являются рибопереключатели.Рибопереключатели представляют собой бактериальные цис-регуляторные элементы, которые встречаются в 5’-UTR мРНК и изменяют ослабление транскрипции или инициацию трансляции гена (ов) непосредственно ниже по течению в ответ на специфический лиганд [5,6]. Это достигается за счет координации между доменом аптамера, который связывает лиганд, и платформой экспрессии, которая переводит это связывание в экспрессию нижестоящего гена. Несколько рибопереключателей идентифицированы во многих типах бактерий [6,35–39] и могут иметь древнее происхождение [40,41].Однако рибопереключатели также эволюционировали в различных экологических и генетических контекстах. Как правило, аптамерные домены структурно хорошо консервативны, в то время как платформы экспрессии могут сильно варьировать у разных видов бактерий: виды Firmicutes и Fusobacteria демонстрируют предпочтение ослабления транскрипции, а виды Proteobacteria и Actinobacteria предпочитают механизмы ингибирования трансляции [6 ].

Широкое распространение и структурно хорошо консервативные домены аптамеров рибопереключателей делают их полезными моделями для лучшего понимания эволюции мотивов структурированной РНК.Рибопереключатель глицина предоставляет уникальную возможность напрямую оценить, как архитектура рибопереключателя может меняться с течением времени или зависеть от того, какие гены регулируются. Рибопереключатель глицина обычно находится в тандемной конформации, где два гомологичных аптамера взаимодействуют посредством третичных контактов, чтобы регулировать единую платформу экспрессии (тандем) [42]. Более обычная конформация с одним аптамером также встречается в природе (синглетон), но синглтонные глициновые рибопереключатели требуют «призрачного аптамера», который функционирует как каркас для третичных взаимодействий, подобных тем, которые наблюдаются в тандемных глициновых рибопереключателях [43].Синглтоны глицинового рибопереключателя делятся на два типа, различающиеся расположением аптамера-призрака по отношению к аптамеру, связывающему лиганд. Синглтоны типа 1 имеют аптамер-призрак 3 ’аптамера, в то время как аптамер-призрак представляет собой 5’ аптамер глицина для синглетонов типа 2 [43]. Взаимосвязь между одиночными и тандемными глициновыми рибопереключателями недостаточно хорошо изучена, и вопрос о том, как и почему возникновение и сохранение тандемных и одиночных рибопереключателей, является предметом дискуссий. Глициновые рибопереключатели были идентифицированы, регулируя несколько различных наборов генов (геномный контекст) [42,44–46], и могут функционировать либо как экспрессирующие активаторы (On-switch) [42], либо как репрессоры (Off-switch) [46].

Чтобы оценить взаимосвязь между одиночными и тандемными глициновыми рибопереключателями, мы использовали как традиционную филогенетику, так и подходы кластеризации графов для изучения последовательностей глициновых аптамеров у ряда различных видов бактерий. Наше исследование показывает, что влияние геномного контекста на то, что тандемный глицин-связывающий аптамер является более консервативным. Это также демонстрирует, что одиночные рибопереключатели больше похожи на первый или второй тандемный аптамер в зависимости от геномного контекста.Взятые вместе, наши результаты убедительно свидетельствуют о том, что многие одноэлементные глициновые рибопереключатели являются результатом деградации тандемов, причем геномный контекст диктует, какой глицин-связывающий аптамер сохраняет лиганд-реактивность.

Результаты

Рибопереключатели глицина в кластере семейств

Bacillaceae и Vibronaceae на основе геномного контекста

Конформация тандемного глицинового рибопереключателя хорошо изучена биофизически [44,45,47–51]. Однако нет единого мнения относительно механизма связывания лиганда или того, какой из тандемных аптамеров более важен для связывания лиганда, чтобы индуцировать регуляцию гена.Обширное исследование in vitro тандемного глицинового рибопереключателя, происходящего от Vibrio cholerae , показало, что связывание лиганда второго аптамера (аптамера-2) контролирует платформу экспрессии и экспрессию гена, в то время как первый аптамер (аптамер-1) в первую очередь играет роль роль в структурной стабилизации и димеризации аптамеров [44]. Однако исследование in vivo тандемного глицинового рибопереключателя в Bacillus subtilis показало, что нарушение связывающего кармана аптамера-1 препятствует регуляции рибопереключателя сильнее, чем нарушение аптамера-2 [45].Чтобы устранить различия, наблюдаемые между V . cholerae и тандемные рибопереключатели B. subtilis , мы провели всесторонний анализ последовательности глициновых аптамеров.

Для идентификации глициновых рибопереключателей аптамеров мы использовали модель ковариации RFAM RF00504 для поиска RefSeq77 [14,15,52]. Идентифицированные аптамеры в пределах 100 нуклеотидов (нуклеотидов) друг от друга считались частью тандемного рибопереключателя. Модель ковариации тандемного аптамера была создана с использованием инфернала и обучена на основе этого идентифицированного набора и использована для поиска RefSeq77 для дополнения набора данных [12,13].Всего было идентифицировано 2998 индивидуальных рибопереключателей, 2216 тандемных рибопереключателей и 782 одиночных рибопереключателя. Каждый был классифицирован по геномному контексту на основе аннотированной функции RefSeq предположительно регулируемого гена. Этот набор данных не включает вариантные глициновые рибопереключатели, идентифицированные в предыдущем исследовании [53], поскольку подавляющее большинство этих примеров присутствует в метагеномных данных и, следовательно, не входит в RefSeq77.

Чтобы определить, наблюдаются ли функциональные различия между глициновыми рибопереключателями из B . subtilis и V . cholerae отражают обнаруживаемую вариацию / дивергенцию последовательностей в их соответствующих семьях, мы сначала провели филогенетический анализ на примерах из нашего набора данных, обнаруженных в бактериальных семействах Bacillaceae и Vibrionaceae . Мы собрали последовательности, охватывающие оба аптамера из 48 тандемных рибопереключателей Bacillaceae и 37 Vibrionaceae . В этом наборе все 37 рибопереключателей Vibrionaceae регулируют транспортные белки (TP), тогда как 41 рибопереключателей Bacillaceae регулируют систему расщепления глицина (GCV), а остальные 7 регулируют TP ( S1 Table ).Затем мы использовали RAxML для создания филогенетического дерева (, рис. 1А, ) из ​​этих последовательностей и согласованной вторичной структуры от выравнивания до нашей тандемной модели ковариации с использованием Infernal. Дерево показывает кластеризацию внутри группы рибопереключателей Bacillaceae , регулирующих GCV, а также внутри группы рибопереключателей Bacillaceae , регулирующих TP. Однако существует четкое филогенетическое разделение двух групп рибопереключателей Bacillaceae , разделяющих их на отдельные клады.Более того, клада, представляющая Bacillaceae, рибопереключателей, регулирующих TP, более тесно сгруппирована с кладой рибопереключателей из Vibrionaceae , регулирующих TP, хотя каждый набор формирует отдельную группу. Это открытие предполагает, что геномный контекст может играть важную роль в эволюции тандемных глициновых рибопереключателей.

Рис. 1. Филогенетическое сравнение тандемных рибопереключателей Bacillaceae и Vibrionaceae.

A) 48 Bacillaceae и 37 Vibrionaceae тандемных рибопереключателей были сгруппированы на основе последовательности аптамера и структуры обоих аптамеров рибопереключателя.После филогенетической кластеризации отдельные аптамеры были окрашены в зависимости от класса регулируемого гена и бактериального семейства происхождения ( Vibrionaceae TP — оранжевый, Bacillaceae TP — фиолетовый, Bacillaceae GCV — зеленый). Кластеры были помечены семейством бактерий и классом генов, подлежащих регулированию. Значения поддержки начальной загрузки отображаются для 100 повторов, когда> = 70. B, C) Филогенетическая кластеризация 48 тандемных рибопереключателей, разделенных на аптамер-1 (B) и аптамер-2 (C), взятых из семейства Bacillaceae и окрашенных в соответствии с классу регулируемого гена (GCV — зеленый, TP — фиолетовый).Все деревья имеют средний корень.

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.g001

Тандемные рибопереключатели Bacillaceae демонстрируют различные паттерны консервации аптамера в зависимости от геномного контекста

Чтобы исследовать, происходит ли эволюционное давление, управляющее дивергенцией тандемных глициновых рибопереключателей, регулирующих GCV и TP, равномерно по обоим аптамеру или является специфическим для одного аптамера, мы разделили тандемные рибопереключатели в семействе Bacillaceae на отдельные аптамеры (таблицы S2 и S3 ).Это дало нам две группы: одну, содержащую все аптамеры-1 (первый аптамер), и одну, содержащую все аптамеры-2 (второй аптамер). Затем мы сгенерировали филогенетическое дерево для каждого набора, чтобы определить, объясняется ли филогенетическая дивергенция, наблюдаемая в наборе рибопереключателей, вариациями в пределах одного конкретного аптамера или присутствует в обоих ( Fig 1B и 1C) . Наборы аптамер-1 и аптамер-2 демонстрируют четкую кластеризацию на основе геномного контекста. Это указывает на то, что дивергенция тандемных глициновых рибопереключателей в разных геномных контекстах не может быть полностью объяснена вариациями в пределах одного только первого или второго аптамера.Более того, в контексте GCV оказывается, что аптамер-1 более высококонсервативен, чем аптамер-2, на что указывает более короткая длина ветвей по всей кладе ( фиг. 1B и 1C) .

Геномный контекст диктует кластеризацию аптамеров в

Bacillaceae и Vibrionaceae

Чтобы лучше понять, как разошлись гомологичные аптамеры тандемного глицинового рибопереключателя, мы расширили наши таксономические рамки и сосредоточили наше исследование на отдельных аптамерных доменах глицинового рибопереключателя.Однако более короткая длина последовательности отдельных аптамеров глицина затрудняла наш анализ. Таким образом, относительная консервативность аптамера-1 до аптамера-2 в различных геномных контекстах была исследована с использованием графической кластеризации всех аптамеров Bacillaceae и Vibrionaceae в пределах данного геномного контекста, за исключением идентичных пар аптамеров, происходящих из разных штаммов одного и того же вида. Этот набор состоял из 84 пар аптамера-1 и аптамера-2 из Bacillaceae , регулирующих GCV, и 36 пар из Vibrionaceae , регулирующих TP ( S4 и S5, таблицы ).Количество рибопереключателей TP было уменьшено на один в этом анализе по сравнению с предыдущим, поскольку один из рибопереключателей больше не был уникальным в наборе при оценке только индивидуальных последовательностей аптамера.

Мы сгенерировали сети, состоящие из вершин, соответствующих индивидуальным глициновым рибопереключателям аптамеров, с ребрами, взвешенными на основе попарной оценки расстояния RNAmountAlign [34]. RNAmountAlign был выбран в качестве основного показателя для взвешивания ребер в нашей работе из-за реализованного использования информации о первичной последовательности и ансамблевого расстояния до вторичной структуры для получения парной оценки быстрее и эффективнее, чем в другом программном обеспечении.После взвешивания с помощью RNAmountAlign края были обрезаны, если они были ниже выбранного порогового значения RNAmountAlign, тем самым изменяя топологию сети с полностью попарной на содержащую кластеры аптамеров, сходство которых превышает пороговое значение. Пороговое значение было выполнено по ряду оценок RNAmountAlign для идентификации консервативных групп аптамеров, которые сохранили плотную кластеризацию (, рис. 2А, ). Каждая сеть соответствует определенному геномному контексту, TP или GCV. Мы обнаружили, что в этих контекстах аптамеры группируются в зависимости от их положения в тандемной структуре (аптамер-1 vs.аптамер-2). Плотность сети, определяемая как доля ребер, присутствующих в группе, по сравнению с общим количеством ребер в сети без порога, была рассчитана по диапазону пороговых значений оценки RNAmountAlign и использована для измерения относительной сохранности каждого типа аптамера для каждого геномного контекста ( Рис. 2B ). Различия в плотности кластеров между типами аптамеров показали, что геномный контекст влияет на то, какой аптамер более консервативен: аптамер-1 более высококонсервативен в рибопереключателях, регулирующих GCV, тогда как аптамер-2 более высококонсервативен в тех, которые регулируют TP.Анализ суммы рангов Уилкоксона для всех внутригрупповых краев был также выполнен для подтверждения этих результатов (, рис. 2С, ). Мы получаем очень похожие результаты, используя различные альтернативные метрики расстояния, рассчитанные с помощью Dynalign [30,31], FoldAlign [32,33], Clustal Omega [28] и RNApdist [26,27] ( S1 и S2, рис. ).

Рис. 2. Кластеризация тандемных аптамеров рибопереключателя между Bacillaceae и Vibrionaceae.

A) Bacillaceae и Vibrionaceae тандемные аптамеры рибопереключателя были сгруппированы с использованием RNAmountAlign в качестве метрики расстояния (порог 5).Все представленные рибопереключатели Bacillaceae регулируют GCV (вверху), а рибопереключатели Vibrionaceae регулируют TP (внизу). Аптамеры окрашены в зависимости от типа аптамера, пурпурный для аптамера-1 и зеленый для аптамера-2. Б) Плотность сети рассчитывалась для каждого аптамера в обеих сетях в диапазоне пороговых значений RNAmountAlign. Пунктирная красная линия указывает порог RNAmountAlign (5), при котором сети в A были визуализированы. C) Ящичковые блоты представляют все попарные веса ребер в пределах каждого типа аптамера. **** p-значение <2x10 -16 .

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.g002

Бактерии класса Bacilli демонстрируют кластеризацию одноэлементных и тандемных аптамеров вместе

Чтобы оценить взаимосвязь между одиночными и тандемными рибопереключателями, мы реализовали кластеризацию графов отдельных аптамеров из тандемных и одиночных глициновых рибопереключателей. Сначала мы классифицировали одноэлементные аптамеры в нашем наборе данных (включая все бактерии, refseq77-microbial) на одноэлементный тип 1 или одноэлементный тип 2 в зависимости от того, был ли аптамер-призрак обнаружен в 3 ’или 5’ от глицинового аптамера.Из 782 одноэлементных рибопереключателей 342 были охарактеризованы как одноэлементный тип-1, 125 — как одноэлементный тип-2, а 305 не могли быть окончательно охарактеризованы как один или другой (обозначенный как одноэлементный тип-0) ( S6, таблица ). Мы обнаружили, что одноточечные рибопереключатели типа 1 регулируют GCV в 93% случаев, в то время как 90% одноточечных рибопереключателей типа 2 регулируют TP. Этот контекстно-зависимый вид одноэлементных рибопереключателей согласуется с предыдущими выводами и дает уверенность в нашем конвейере одноэлементных аннотаций [54].

Затем мы реализовали кластеризацию графов на наборе, содержащем все аптамеры глицинового рибопереключателя из Bacilli , за исключением идентичных аптамеров, происходящих из разных штаммов одного и того же вида, всего 436 аптамеров ( Fig. 3A ) ( S7 Table ). Этот набор из класса Bacilli был выбран из-за того, что он представляет рибопереключатели, регулирующие как GCV (58%), так и TP (31%). Остальные рибопереключатели были помечены как регулирующие гены, участвующие в метаболизме глицина (Gly_Met), которые не являются частью оперона GCV, или как другие.Используя четыре различных алгоритма обнаружения сообществ de novo , доступных в R (см. Методы), мы идентифицировали модульные сообщества в наборе. Сообщества были выбраны на основе основного кластера каждой группы, который присутствовал во всех используемых алгоритмах обнаружения сообществ. Аптамеры, которые были сгруппированы с основным кластером, по крайней мере, в половине алгоритмов обнаружения сообществ, были впоследствии добавлены в кластер. Стабильность кластера была проверена с использованием 100 повторов параметрической начальной загрузки ( S3, рис. ) (см. Методы), а также сравнения результатов кластеризации с MCL [55] ( S4, рис. ) и DBSCAN [56] ( S5, рис. ).В результате были получены кластеры, состоящие из высококонсервативного набора ядер и тесно сгруппированных с ними аптамеров. Большинство сообществ содержат либо аптамеры, происходящие от тандемного расположения, либо одиночные аптамеры. Однако два сообщества включали как синглетные, так и тандемные аптамеры. Первый содержит одноэлементные аптамеры типа 1 и аптамер-1 тандемных рибопереключателей, все из которых регулируют GCV. Второй включает одноэлементные аптамеры типа 2 и аптамер-2 тандемных рибопереключателей, все из которых регулируют TP ( Fig. 3B ).

Рис. 3. Кластеризация аптамеров глицинового рибопереключателя, идентифицированных в классе бактерий Bacilli.

A) Аптамеры бактериального класса Bacilli были идентифицированы и сгруппированы на основе попарного сходства RNAmountAlign (визуализировано при пороге 12). Б) Подкластеры (сообщества) были идентифицированы с использованием четырех функций обнаружения сообществ в пакете R’s igraph. Были идентифицированы два сообщества, которые содержат два разных типа аптамеров: аптамер-1 и синглетный тип-1, а также аптамер-2 и синглетный тип-2, которые регулируют GCV и TP соответственно.Сеть показывает визуализацию алгоритма обнаружения сообщества cluster_fast_greedy (как реализовано R). Цвета узлов соответствуют определенным обнаруженным кластерам. C) Два подкластера, содержащие разные типы аптамеров, были проанализированы из общей сети, партнеры тандемных аптамеров были добавлены в набор (как выходная группа в том же контексте), и была визуализирована кластеризация графов (порог RNAmountAlign, равный 5). . D) Плотность границ между группами аптамеров была рассчитана для сетей, созданных в диапазоне пороговых значений краевого веса RNAmountAlign.Пунктирная красная линия указывает порог RNAmountAlign (5), при котором сети в (C) были визуализированы.

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.g003

Были извлечены члены обоих смешанных сообществ и для каждого из них были созданы сети, как описано выше (, рис. 3C, ). Для аптамеров, изначально являющихся частью тандемного расположения, спаренный аптамер был включен для оценки относительной консервации ( S8 и S9, таблицы ) синглетных аптамеров для каждого типа тандемных аптамеров.Мы определили относительную сохранность между типами аптамеров, вычислив сетевую плотность ребер, соединяющих каждый тип аптамера (межреберная плотность) (, рис. 3D, ), в диапазоне пороговых значений RNAmountAlign. Мы наблюдаем, что одноэлементные аптамеры типа 1, регулирующие GCV, наиболее похожи на аптамер-1 тандемных рибопереключателей в том же контексте и, наоборот, что одноэлементные аптамеры типа 2, регулирующие TP, наиболее похожи на аптамер-2 тандемных рибопереключателей в том же контексте. Плотность между краями одноэлементных аптамеров типа 1 и тандемных аптамеров-1, регулирующих GCV, сравнима с плотностью, наблюдаемой между одноэлементными аптамерами типа 2 и регулирующими TP тандемного аптамера-2 ( Fig. 3D ).Эти две группы также представляют наивысшую сохранность среди типов аптамеров в их сетях, при этом другие пары сопоставимы с измерениями межрайевой плотности со случайным набором из 40 аптамеров ( S10, таблица ). Использование Dynalign, FoldAlign, Clustal Omega и RNApdist в качестве показателей расстояния дает аналогичные результаты ( S6 и S7, рис. ).

Для дальнейшего изучения сходства между этими аптамерами мы сгенерировали консенсусные структуры рибопереключателей, обнаруженных в каждом геномном контексте, используя комбинацию инструментов (см. Методы).Консенсусные структуры рибопереключателей, регулирующих GCV, показывают, что тандемный аптамер-1 и одиночные аптамеры типа 1 имеют высокую консервативность стеблей P2 и P3, а также связывающего кармана, в то время как стебель P1 тандемного аптамера-2 демонстрирует высокую консервативность с одиночным типом -1 фантомный аптамер (, фиг. 4A и 4B, ). Эта консервация ствола аптамера P1 коррелирует с областью, необходимой для третичных взаимодействий тандемных и одноэлементных рибопереключателей [43]. Это наблюдается и в рибопереключателях, регулирующих TP, за исключением того, что аптамер одиночного типа 2 и тандемный аптамер-2 являются консервативными аптамерами ( Fig. 4C и 4D ).

Рис. 4. Консенсусные структуры рибопереключателей Bacilli в пределах данного геномного контекста демонстрируют консервативность между тандемными и одиночными аптаперами.

Консенсусная вторичная структура одноэлементных и тандемных рибопереключателей, очерченная геномным контекстом. Сохранение и ковариация пар оснований, созданных с использованием R2R с индивидуальными моделями ковариации. Тандемные (A) и одноточечные (B) рибопереключатели, регулирующие GCV. Тандемные (C) и одноточечные (D) рибопереключатели, регулирующие TP.

https: // doi.org / 10.1371 / journal.pcbi.1007564.g004

В совокупности наши результаты указывают на три вещи, касающиеся аптамеров глицинового переключателя Bacilli в каждом геномном контексте: 1) один тандемный аптамер демонстрирует высокую степень консервативности для одноэлементного аптамера, 2) консервативность между Альтернативный тандемный аптамер и одноэлементный аптамер не больше, чем сохранение синглтона в случайном наборе глициновых рибопереключателей, и 3) расположение призрачного аптамера коррелирует с менее консервативным тандемным аптамером.Это соответствует модели, в которой эти одноэлементные рибопереключатели являются результатом тандемной деградации рибопереключателей, и какой аптамер следует сохранить, а какой подвергнуться деградации, зависит от геномного контекста. Если бы ситуация была обратной и тандемы были результатом событий дублирования одноэлементных рибопереключателей, мы бы ожидали более высокой консервации между одноэлементным аптамером и обоими тандемными аптамерами по сравнению со случайным набором глициновых рибопереключателей. Однако мы наблюдаем такую ​​консервацию только с одним тандемным аптамером в каждом геномном контексте.

Актинобактерии рибопереключателей демонстрируют аналогичный образец кластеризации, наблюдаемый у бацилл

Чтобы определить, наблюдаются ли эти закономерности в других кладах бактерий, мы собрали все глициновые аптамеры в нашем наборе данных в филуме Actinobacteria (отдаленно связанных как с классами Vibrio , так и с Bacilli , проанализированными ранее), за исключением идентичных аптамеров. из разных штаммов одного и того же вида, всего 606 аптамеров ( S11, таблица ).Затем мы оценили все аптамеры в наборе так же, как и в нашем исследовании Bacilli . Внутри этого типа глициновые рибопереключатели в первую очередь регулируют GCV (74%) или другие гены, участвующие в метаболизме глицина (22%). Мы идентифицировали группу из 34 консервативных аптамеров, соответствующих рибопереключателям, регулирующим GCV ( S8A, рис. ), и использовали алгоритмы обнаружения сообщества de novo , чтобы подтвердить наше наблюдение ( S8B рис. ). Стабильность кластера была проверена с использованием 100 повторов параметрической начальной загрузки ( S3, рис. ) (см. Методы), а также сравнения с результатами кластеризации MCL ( S9, рис. ) и DBSCAN (S10, , рис. ).Аптамеры в этой группе состояли в основном из одноэлементных аптамеров типа 1 и тандемных последовательностей аптамеров-1, с пятью одноэлементными последовательностями аптамеров типа 0 и двумя одноэлементными последовательностями аптамеров типа 2, составляющими оставшуюся часть. Одноэлементные аптамеры типа 2 в наборе могут быть неправильно классифицированными аптаперами или примерами одноэлементных аптамеров, которые не соответствуют паттернам, наблюдаемым для других исследованных аптамеров. Мы выполнили кластеризацию графов в группе с парными тандемными аптамерами-2, включенными в качестве внешней группы, для исследования сохранения типов аптамеров ( S8C, фиг. ) ( S12, таблица, ).Затем мы вычислили плотности краев внутри и между одноэлементными аптамерами типа 1, тандемными аптамерами-1 и тандемными аптамерами-2, которые демонстрируют четкую консервацию между одноэлементными аптамерами типа 1 и тандемными аптамерами-1 ( S8D, рис. ). Эти результаты соответствуют нашим выводам, сделанным для бактерий класса Bacilli . Использование Dynalign, FoldAlign, Clustal Omega и RNApdist в качестве показателей расстояния дает аналогичные результаты ( S11 Рис. ).

Кластеризация на основе геномного контекста наблюдается во всем бактериальном царстве

Чтобы определить, отражаются ли паттерны кластеризации, наблюдаемые в пределах класса Bacilli и типа Actinobacteria , во всем остальном бактериальном царстве и могут ли наблюдаться среди случайно выбранных аптамеров, мы случайным образом выбрали 150 различных аптамеров глицинового рибопереключателя, каждый для GCV и TP. геномный контекст ( S13 и S14 таблицы ).В нашей выборке сохранено сопоставимое количество аптамеров каждого типа и исключены одноэлементные аптамеры типа 0. Синглтон-аптамеры типа 1 и типа 2 недостаточно представлены в регулирующих наборах TP и GCV, соответственно, потому что каждый тип аптамеров имеет несколько экземпляров в этом геномном контексте. Несмотря на разнообразный таксономический диапазон, представленный в этом наборе данных, сгенерированные сети демонстрируют шаблоны кластеризации, которые согласуются с нашими предыдущими наблюдениями: тенденция к кластеризации одноэлементных аптамеров типа 1 с тандемными аптамерами-1 при регуляции GCV и кластеризация одноэлементных аптамеров типа 2. с тандемным аптамером-2 при регулировании TP ( Рис. 5) .Графики межкраевой плотности аптамеров показывают тенденции, аналогичные тем, которые наблюдаются в пределах класса Bacilli и типа Actinobacteria ( S12, рис. ). Использование Dynalign, FoldAlign, Clustal Omega и RNApdist в качестве показателей расстояния дает аналогичные результаты ( S13 и S14, рис. ).

Рис. 5. Кластеризация случайных аптамеров глицинового рибопереключателя в бактериальном царстве.

A) Сетевая визуализация 150 случайно выбранных аптамеров, регулирующих GCV и сгруппированных на основе попарного сходства RNAmountAlign (порог -5).B) Сетевая визуализация 150 случайно выбранных аптамеров, регулирующих TP и сгруппированных на основе попарного сходства RNAmountAlign (порог -5). В этот набор были включены только синглтоны, которые можно было классифицировать как тип 1 или тип 2.

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.g005

Обсуждение

Тандемные аптамеры глицинового рибопереключателя очаровали РНК-биологов с момента их идентификации в 2004 году [42,57]. Обширная работа позволила оценить, работают ли два гомологичных аптамера тандемного глицинового рибопереключателя кооперативно [47-50], какой тандемный аптамер был более важен для связывания лиганда [44,45], и какие преимущества, если таковые имеются, имеют тандемную конформацию, обеспечиваемую по сравнению с одноэлементный глициновый рибопереключатель [43].В этой работе мы используем кластерный анализ графа для исследования столь же распри вопроса: какова эволюционная связь между тандемным и синглтоном глицином riboswitches? Хотя может показаться интуитивным предположение, что идентифицированные тандемные рибопереключатели являются результатом дублирования идентифицированных одноэлементных рибопереключателей, наши результаты указывают на то, что большинство одноэлементных рибопереключателей являются результатом деградации тандемных рибопереключателей.

Филогенетическая оценка тандемных рибопереключателей Bacillaceae и Vibrionaceae показала, что геномный контекст влияет на эволюцию рибопереключателей.Это иллюстрируется рибопереключателями Bacillaceae , которые регулируют группировку TP более близко, с рибопереключателями Vibrionaceae , регулирующими TP, чем с рибопереключателями Bacillaceae , регулирующими GCV. Дальнейшее исследование отдельных аптамеров тандемных рибопереключателей Bacillaceae , регулирующих GCV по сравнению с TP, показало, что оба аптамера индивидуально демонстрируют одинаковый образец дивергенции.

Сделав еще один шаг в этом анализе с помощью кластеризации графов, мы смогли определить, что геномный контекст диктует, какой аптамер в тандемном глициновом рибопереключателе более высококонсервативен: аптамер-1 более высококонсервативен в рибопереключателях, регулирующих GCV, а аптамер-2 — более консервативен. очень консервативны в тех, которые регулируют TP.Эти находки дают элегантный ответ на противоречие в области, в которой исследования различных гомологов глицинового рибопереключателя дали разные результаты относительно того, является ли связывание лиганда первого или второго аптамера более важным для функциональности [44,45]. Наши результаты согласуются с выводами обоих исследований: аптамер, идентифицированный как важный связывающий партнер для регуляции в каждом исследовании, является аптамером, который, как было установлено в нашем исследовании, является более консервативным в этом геномном контексте. С учетом результатов этих предыдущих исследований в сочетании с этой новой перспективой, предоставленной нашими данными, разумно сделать вывод, что разница в геномном контексте заставляет глициновые рибопереключатели сохранять различные первичные связывающие лиганд аптамеры.Широко распространенный горизонтальный перенос рибопереключателя с сопровождающим его геном может объяснить наши выводы. Чтобы исследовать эту возможность, мы создали деревья генов для аминометилтрансфераз и симпортеров, которым предшествовали глициновые рибопереключатели. От этих деревьев имеется ограниченное свидетельство горизонтального переноса этих генов ( S15 и S16, фиг. ) ( S15 и S16, таблицы ).

Наше наблюдение, что эволюция тандемных глициновых рибопереключателей зависит от геномного контекста, заставило нас усомниться в влиянии геномного контекста на одиночные глициновые рибопереключатели.Мы расширили наш сетевой анализ на одноэлементные рибопереключатели, что дало ценную информацию о взаимосвязи тандемных и одноэлементных глициновых рибопереключателей. Кластеризация одноэлементных и тандемных аптамеров из клад Bacilli и Actinobacteria показала, что одноэлементные аптамеры больше похожи на первый или второй тандемный аптамер на основе геномного контекста: одиночные аптамеры типа 1, регулирующие GCV, более похожи на аптамер-1 тандемы, регулирующие GCV, тогда как одноэлементные аптамеры типа 2, регулирующие TP, больше похожи на аптамер-2 тандемов, регулирующих TP.Это сходство синглтонов с одним тандемным аптамером в геномном контексте подчеркивается тем фактом, что одиночные аптамеры не обнаруживают большего сходства с другим тандемным аптамером, чем со случайным набором из 40 аптамеров глицинового рибопереключателя. Это наблюдается в рибопереключателях, регулирующих как GCV, так и TP, и подводит нас к выводу, что одноэлементные рибопереключатели являются остатками деградированных тандемных аптамеров.

Мы предлагаем модель эволюционного пути глицинового рибопереключателя, в которой тандемные рибопереключатели становятся одноэлементными рибопереключателями, подвергаясь деградации одного аптамера в аптамер-призрак, который сохраняет области, соответствующие третичному взаимодействию ( Рис.В этой модели консервативный аптамер зависит от геномного контекста. Различная консервация тандемных аптамеров, основанная на геномном контексте, также соответствует недавним исследованиям, которые демонстрируют высокую вероятность того, что то, регулирует ли глициновый рибопереключатель TP или GCV, является предиктором того, являются ли они переключателем включения или выключения [42,45,46,54]. Это соответствует логической модели клеточного ответа на высокие концентрации глицина как токсина [45,58–62]: гены, ответственные за деградацию глицина, активируются, а гены, участвующие в поглощении глицина, становятся подавленными.Таким образом, рибопереключатели в каждом геномном контексте защищают клетку от токсичности глицина при увеличении концентрации. Это различие в функциях регуляции объясняет расхождение рибопереключателей в разных геномных контекстах, что приводит к консервации разных аптамеров и, в конечном итоге, к образованию одноэлементных рибопереключателей. Возможно, что некоторые синглтоны могли возникнуть в результате делеции средней части тандемного рибопереключателя, оставив 5 ’половину аптамера 1 и 3’ половину аптамера 2, в результате чего образовался синглтон.Однако этот сценарий кажется маловероятным, поскольку он не учитывает аптамер-призрак, который важен для структурной стабильности глицинового рибопереключателя.

Рис. 6. Модель эволюции глицинового рибопереключателя.

Предложенная модель эволюции и расхождения глицинового рибопереключателя. В этой модели тандемный рибопереключатель-предшественник сохраняет один из тандемных аптамеров на основе геномного контекста рибопереключателя, в то время как другой медленно деградирует до минималистичных компонентов, необходимых для третичного взаимодействия, чтобы управлять регуляцией генов.Таким образом, тандемные глициновые рибопереключатели могут распадаться на функциональные одноэлементные тандемные рибопереключатели.

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.g006

Хотя мы использовали кластеризацию графов, чтобы выявить конкретное несоответствие, возникающее в существующих экспериментальных данных, наш подход может быть использован в более широком смысле для оценки того, как другие рибопереключатели и другие нкРНК развиваются и изменяются с течением времени. Вариации гомологичных аптамеров рибопереключателя продемонстрировали функциональные последствия.Существует ряд различных классов рибопереключателей, которые взаимодействуют с разными лигандами [53,63,64], наиболее привлекательными из которых являются гомологичные рибопереключатели ykkC [57,65], которые включают по крайней мере пять подклассов, каждый из которых связывает различные лиганд, участвующий в деградации и экспорте гуанидина [39,66–68]. Существуют также примеры, когда различные по структуре рибопереключатели взаимодействуют с одними и теми же или очень похожими лигандами, такими как семь классов рибопереключателей, участвующих в регуляции концентрации S-аденозилметионина [69,70].Эти РНК включают рибопереключатель SAM / SAH, который был предложен как минималистичная форма рибопереключателя SAM, который эволюционировал в организмах, которые легко разрушают SAH [71]. Подходы, которые мы разработали, позволяют обойти ограничения традиционных филогенетических методов оценки сходства нкРНК и позволяют идентифицировать закономерности в консервации аптамеров, которые могут указывать на различия в биологической функции у разных организмов.

Материалы и методы

Идентификация рибосвитча

Функция cmsearch

Infernal была использована для запроса всех бактериальных геномов RefSeq77 с использованием ковариантной модели глицинового рибопереключателя RFAM для идентификации всех индивидуальных предполагаемых аптамеров глицинового рибопереключателя (RF00504) [13,14,52].Все совпадения были отфильтрованы на основе e-value с порогом 1 x 10 -5 . Предполагаемые рибопереключатели были разделены на компоненты одноэлементного или тандемного глицинового рибопереключателя на основании их близости к любому другому предполагаемому аптамеру. Два попадания в пределах 100 м друг от друга считались двумя аптаперами тандемного рибопереключателя; наибольшее расстояние между наблюдаемыми тандемными аптамерами составляло 32 нс. Затем мы использовали набор из 30 тандемных рибопереключателей для создания модели ковариации, которая идентифицировала оба тандемных рибопереключателя вместе.Сгенерированная модель способна идентифицировать тандемные аптамеры глицинового рибопереключателя, но не включает явно платформу экспрессии из-за разнообразия механизмов действия глицинового рибопереключателя. Эта модель тандемной ковариации была использована для запроса базы данных бактерий RefSeq77 и дополнения нашего текущего набора предполагаемых глициновых рибопереключателей любыми тандемами, которые могли быть пропущены моделью ковариации RFAM. Было идентифицировано 2998 индивидуальных рибопереключателей, 2216 тандемных рибопереключателей и 782 одиночных рибопереключателя.Синглтоны затем были классифицированы как тип-1 или тип-2 на основе местоположения аптамера-призрака, соседней стебельной структуры, которая функционирует как каркас для третичного взаимодействия с лиганд-связывающим аптамером. Расположение аптамера-призрака было определено на основе соответствия моделям ковариации, полученным из одноточечных рибопереключателей типа 1 и типа 2, описанных в [54]. Из наших 782 одноэлементных рибопереключателей 342 были охарактеризованы как синглетный тип-1, 125 были охарактеризованы как одноэлементный тип-2, а 305 не могли быть охарактеризованы как один или другой (называемый одноэлементным типом-0).Bedtools использовали для определения ближайшего нижестоящего гена в пределах 500 нуклеотидов на той же цепи, обеспечивая ген, который предположительно регулируется каждым данным рибопереключателем [72]. Гены были объединены на основе функции определения геномного контекста глицинового рибопереключателя.

Филогенетический анализ Riboswitch

тандемных рибопереключателя были сгруппированы на основе таксономического происхождения и геномного контекста. Чтобы включить информацию о вторичной структуре, группы были выровнены с использованием функции mlocarna LocARNA для выравнивания и сворачивания de novo [73–75] и функции cmalign Infernal для согласования с моделью тандемной ковариации [12,13].Филогенетические деревья максимального правдоподобия были созданы из этих выровненных групп с использованием RAxML [9]. Деревья из сопоставлений, сгенерированных с помощью cmalign, были запущены с сопровождающим файлом вторичной структуры для проведения филогенетического анализа максимального правдоподобия, основанного на последовательности и структуре аптамера. В каждом случае было выполнено 100 повторений начальной загрузки, и указаны значения доверительной вероятности начальной загрузки> = 70.

Кластеризация графиков и создание сети

Графики последовательностей аптамеров были сгенерированы с вершинами, представляющими отдельные аптамеры, и ребрами, представляющими метрику попарного сходства, относящуюся к парам аптамеров.Затем были установлены пороговые значения для весов краев, в результате чего были обрезаны сети сгруппированных аптамеров, содержащие только ребра, соединяющие пары с более высоким сходством, чем пороговое значение. Сети аптамеров были созданы для определения кластеризации на основе ряда различных попарных показателей. К ним относятся функция распределения (RNApdist) [26,27], сходство последовательностей и структур (FoldAlign и Dynalign) [30–33], ожидаемая высота горы по ансамблю (RNAmountAlign) [34] и сходство последовательностей (Clustal Omega) [28].Парные значения были использованы для создания и визуализации сетей аптамеров с использованием R-библиотек igraph и qgraph [76,77]. Оптимальные пороги визуализации варьируются между наборами в зависимости от таксономического разнообразия, представленного в них. Кластеризация групп рибопереключателей на основе геномного контекста и типа аптамера сравнивалась по плотности сети в диапазоне пороговых значений для каждой метрики расстояния. Модульные кластеры были идентифицированы с помощью функций идентификации сообщества igraph cluster_fast_greedy, cluster_walktrap, cluster_edge_betweenness и cluster_leading_eigen.

После идентификации кластера мы выполнили 100 копий параметрического анализа начальной загрузки, который нарушает 5% сети, а затем повторно кластеризуется. Этот анализ возмущает сеть, добавляя / удаляя рёбра случайным образом в соотношении 1: 1, в результате чего получается сеть, содержащая одинаковые узлы и эквивалентное количество ребер, но 5% ребер соединяют разные узлы. Для каждой итерации мы определяли новую кластеризацию для нашей группы интересов, используя методы обнаружения сообщества igraph.Затем их сравнивали с исходной группой, в которой не было возмущений. Это сравнение было выполнено на всех 100 итерациях и использует индекс сходства Жаккара для вычисления сходства каждого кластера после возмущения с исходным кластером. Средний индекс сходства Жаккара по 100 итерациям был использован для определения устойчивости наших кластеров ( S3 рис. ). Состав кластера также был подтвержден с помощью кластеризации MCL [55] и DBSCAN [56].

Плотность сети была рассчитана путем определения процента от общего количества возможных попарных ребер, оставшихся для данного набора вершин после обрезки ребер на основе порогового значения метрики расстояния.Вычисления межгрупповой и внутригрупповой плотности представляют собой граничную плотность внутри группы и между группами, соответственно. Плотность сети, измеренная в диапазоне пороговых значений, коррелирует с подобием аптамера по отношению к заданной метрике расстояния, используемой для взвешивания краев. Эти сгенерированные графы приравниваются к перевернутому кумулятивному распределению возможных ребер и фактических ребер для кластера, поскольку мы порождаем сеть на основе весов ребер.

Создание структуры консенсуса

Мы сгенерировали Stockholm файлы для наборов рибопереключателей, используя комбинацию функции mlocarna LocARNA [73] и согласования с нашими моделями ковариации с помощью функции cmsearch Infernal [13].Затем Ralee был использован для выполнения небольшого курирования выравниваний, а VARNA была реализована для визуализации вторичной структуры на протяжении всего процесса [78,79]. Затем R2R был использован для создания консенсусных структур на основе этих стокгольмских файлов [80]. Флаг «# = GF R2R SetDrawingParam autoBreakPairs true» использовался для разрешения разрыва пар оснований в случаях, когда стебли аптамера не были высококонсервативными.

Дополнительная информация

S1 Рис. Кластеризация тандемных рибопереключателей Bacillaceae с использованием Dynalign, FoldAlign, Clustal Omega и RNApdist.

A) Внутрикраевая плотность Dynalign в диапазоне от -500 до 0 (ось x перевернута для отображения убывающей плотности).

B) Внутрикраевая плотность FoldAlign в диапазоне от 0 до 2000.

C) Внутрикраевая плотность Clustal Omega в диапазоне от 0 до 100.

D) Плотность между краями RNApdist в диапазоне от 0 до 100 (ось x перевернута для отображения убывающей плотности).

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.s001

(EPS)

S2 Рис. Кластеризация тандемных рибопереключателей Vibrionaceae с использованием Dynalign, FoldAlign, Clustal Omega и RNApdist.

A) Внутрикраевая плотность Dynalign в диапазоне от -500 до 0 (ось x перевернута для отображения убывающей плотности).

B) Внутрикраевая плотность FoldAlign в диапазоне от 0 до 2000.

C) Внутрикраевая плотность Clustal Omega в диапазоне от 0 до 100.

D) Плотность между краями RNApdist в диапазоне от 0 до 100 (ось x перевернута для отображения убывающей плотности).

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.s002

(EPS)

S3 Рис. Стабильность кластера после 100 повторений бутстрапов для кластеризации бацилл и актинобактерий.

Средний индекс сходства Жаккарда после 100 повторений начальной загрузки для кластера Bacilli , регулирующего GCV, кластера Bacilli , регулирующего TP, и кластера Actinobacteria , регулирующего GCV. Первая строка указывает кластер, а первый столбец указывает используемый метод обнаружения сообщества. Методы, как правило, демонстрируют хорошую стабильность кластера, особенно cluster_walktrap. Однако алгоритм cluster_fast_greedy имел тенденцию к перегруппировке кластеров после начальной загрузки, что приводило к плохим индексам сходства Жаккарда для некоторых кластеров.

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.s003

(EPS)

S4 Рис. MCL-кластеризация аптамеров рибопереключателя Bacilli.

A) Bacilli рибосвитч-аптамеров, сгруппированных на основе попарного сходства RNAmountAlign (визуализируется при пороге 8). Цвет узла соответствует типу аптамера, а форма узла соответствует геномному контексту.

B) MCL-кластеризация аптамеров рибопереключателя Bacilli , выполненная с использованием пакета MCL R. Узлы окрашены, чтобы различать отдельные кластеры.

Красные кружки соответствуют (примерно) набору узлов, используемых в нашем основном анализе, который был идентифицирован с помощью четырех функций определения сообщества R’s igraph.

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.s004

(EPS)

S5 Рис. DBSCAN-кластеризация аптамеров рибопереключателей Bacilli.

A) Bacilli рибосвитч-аптамеров, сгруппированных на основе попарного сходства RNAmountAlign (визуализируется при пороге 12). Цвет узла соответствует типу аптамера, а форма узла соответствует геномному контексту.

B) DBSCAN-кластеризация аптамеров рибопереключателя Bacilli , выполненная с использованием пакета R’s fpc. Было использовано значение эпсилон 3,65, и было установлено минимальное количество соседей 4. Узлы окрашены, чтобы различать отдельные кластеры. Кластеризация тандемных аптамеров 1 и одноэлементных аптамеров 1 типа, регулирующих GCV, отмечена голубым цветом.

C) DBSCAN-кластеризация аптамеров рибопереключателя Bacilli , выполненная с использованием пакета R’s fpc. Было использовано значение эпсилон 2,85, а минимальные соседи были установлены 2.Узлы окрашены, чтобы различать отдельные кластеры. Кластеризация тандемных аптамеров 2 и одноэлементных аптамеров 2 типа, регулирующих TP, отмечена желтым цветом.

Красные кружки соответствуют (примерно) набору узлов, используемых в нашем основном анализе, который был идентифицирован с помощью четырех функций определения сообщества R’s igraph.

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.s005

(EPS)

S6 Рис. Кластеризация поднабора аптамера-1 Bacilli и одноэлементного аптамера типа 1 с использованием Dynalign, FoldAlign, Clustal Omega и RNApdist.

A) Dynalign между краями плотности в диапазоне от -500 до 0 (ось x перевернута для отображения убывающей плотности).

B) Плотность FoldAlign между краями в диапазоне от 0 до 2000.

C) Плотность между краями Clustal Omega в диапазоне от 0 до 100.

D) Плотность между краями RNApdist в диапазоне от 0 до 100 (ось x перевернута для отображения убывающей плотности).

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.s006

(EPS)

S7 Рис. Кластеризация подмножества аптамера-2 Bacilli и одноэлементного аптамера типа 2 с использованием Dynalign, FoldAlign, Clustal Omega и RNApdist.

A) Dynalign между краями плотности в диапазоне от -500 до 0 (ось x перевернута для отображения убывающей плотности).

B) Плотность FoldAlign между краями в диапазоне от 0 до 2000.

C) Плотность между краями Clustal Omega в диапазоне от 0 до 100.

D) Плотность между краями RNApdist в диапазоне от 0 до 100 (ось x перевернута для отображения убывающей плотности).

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.s007

(EPS)

S8 Рис. Кластеризация аптамеров глицинового рибопереключателя, идентифицированных в пределах филума бактерий Actinobacteria.

A) Аптамеры в бактериальном типе Actinobacteria были идентифицированы и сгруппированы на основе попарного сходства RNAmountAlign (визуализировано при пороге 12). Б) Подкластеры (сообщества) были идентифицированы с использованием четырех функций обнаружения сообществ в пакете R’s igraph. Было идентифицировано одно сообщество, содержащее в основном два разных типа аптамеров: аптамер-1 и синглетный тип-1. Визуализация дисплея использует алгоритм обнаружения сообщества cluster_fast_greedy. Цвета узлов соответствуют определенным обнаруженным кластерам.C) Сообщество, содержащее различные типы аптамеров, было проанализировано из общей сети, были добавлены партнеры тандемных аптамеров (как выходная группа в том же контексте) и визуализирована кластеризация графов (порог RNAmountAlign, равный 5). D) Плотность границ между группами аптамеров была рассчитана для сетей, созданных в диапазоне пороговых значений краевого веса RNAmountAlign. Сплошные линии соответствуют плотности краев внутри группы, а пунктирные линии соответствуют плотности краев между двумя указанными группами.Пунктирная красная линия указывает порог RNAmountAlign (5), при котором сети в (C) были визуализированы.

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.s008

(EPS)

S9 Рис. MCL-кластеризация аптамеров рибопереключателя актинобактерий.

A) Actinobacteria рибосвитч-аптамеров, сгруппированных на основе попарного сходства RNAmountAlign (визуализируется при пороге 12). Цвет узла соответствует типу аптамера, а форма узла соответствует геномному контексту.

B) MCL-кластеризация аптамеров рибопереключателя Actinobacteria , выполненная с использованием пакета MCL R.Узлы окрашены, чтобы различать отдельные кластеры.

Красные кружки соответствуют (примерно) набору узлов, используемых в нашем основном анализе, который был идентифицирован с помощью четырех функций определения сообщества R’s igraph.

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.s009

(EPS)

S10 Рис. DBSCAN-кластеризация аптамеров рибопереключателя актинобактерий.

A) Actinobacteria рибосвитч-аптамеров, сгруппированных на основе попарного сходства RNAmountAlign (визуализируется при пороге 12).Цвет узла соответствует типу аптамера, а форма узла соответствует геномному контексту.

B) DBSCAN-кластеризация аптамеров рибопереключателя Actinobacteria , выполненная с использованием пакета R’s fpc. Было использовано значение эпсилон, равное 4, и было установлено минимальное количество соседей 8. Узлы окрашены, чтобы различать отдельные кластеры. Кластеризация тандемных аптамеров 1 и одиночных аптамеров типа 1, регулирующих GCV, отмечена оранжевым цветом.

Красные кружки соответствуют (примерно) набору узлов, используемых в нашем основном анализе, который был идентифицирован с помощью четырех функций определения сообщества R’s igraph.

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.s010

(EPS)

S11 Рис. Кластеризация поднабора аптамер-1 актинобактерий и одноэлементного аптамера типа 1 с использованием Dynalign, FoldAlign, Clustal Omega и RNApdist.

A) Dynalign между краями плотности в диапазоне от -500 до 0 (ось x перевернута для отображения убывающей плотности).

B) Плотность FoldAlign между краями в диапазоне от 0 до 2000.

C) Плотность между краями Clustal Omega в диапазоне от 0 до 100.

D) Плотность между краями RNApdist в диапазоне от 0 до 100 (ось x перевернута для отображения убывающей плотности).

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.s011

(EPS)

S12 Рис. Межкраевая плотность случайных сетей аптамеров глициновых рибопереключателей.

150 аптамеров, регулирующих GCV, и 150 аптамеров, регулирующих TP, были случайным образом выбраны из всего бактериального царства и оценены на основе показателя сходства RNAmountAlign. Плотность между краями рассчитывалась между типами аптамеров в диапазоне пороговых значений RNAmountAlign для регулирующего набора GCV (A) и регулирующего набора TP (B).Пунктирная красная линия на графиках указывает порог, при котором кластеры были визуализированы на рис. 5. В этот набор были включены только синглтоны, которые можно было классифицировать как тип 1 или тип 2.

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.s012

(EPS)

S13 Рис. Кластеризация случайных аптамеров рибопереключателя, регулирующих GCV, с использованием Dynalign, FoldAlign, Clustal Omega и RNApdist.

A) Dynalign между краями плотности в диапазоне от -500 до 0 (ось x перевернута для отображения убывающей плотности).

B) Плотность FoldAlign между краями в диапазоне от -500 до 1500.

C) Плотность между краями Clustal Omega в диапазоне от 0 до 100.

D) Плотность между краями RNApdist в диапазоне от 0 до 100 (ось x перевернута для отображения убывающей плотности).

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.s013

(EPS)

S14 Рис. Кластеризация случайных аптамеров рибопереключателя, регулирующих TP, с использованием Dynalign, FoldAlign, Clustal Omega и RNApdist.

A) Dynalign между краями плотности в диапазоне от -500 до 0 (ось x перевернута для отображения убывающей плотности).

B) Плотность FoldAlign между краями в диапазоне от -500 до 1500.

C) Плотность между краями Clustal Omega в диапазоне от 0 до 100.

D) Плотность между краями RNApdist в диапазоне от 0 до 100 (ось x перевернута для отображения убывающей плотности).

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.s014

(EPS)

S15 Рис. Филогенетическое дерево генов, кодирующих gcvT (аминометилтрансферазу) и регулируемых глициновым рибопереключателем.

53 гена gcvT (аминометилтрансферазы), регулируемые глициновыми рибопереключателями, были сопоставлены с использованием MUSCLE.Затем RAxML был использован для создания филогенетического дерева. Затем кончики были окрашены в соответствии с типом бактерий, от которых произошел ген ( Firmicutes — красные, Proteobacteria — синие). Значения поддержки начальной загрузки отображаются для 100 реплик, когда> = 70. B) Все деревья имеют средний корень.

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.s015

(EPS)

S16 Рис. Филогенетическое дерево генов, кодирующих натрий: аминокислотных симпортеров и регулируемых глициновым рибопереключателем.

80 генов натрий-аминокислотных симпортеров, регулируемых глициновыми рибопереключателями, выравнивали с помощью MUSCLE. Затем RAxML был использован для создания филогенетического дерева. Затем кончики окрашивали в соответствии с типом бактерий, от которых происходит ген ( Firmicutes — красные, Proteobacteria — синие, Actinobacteria — зеленые). Значения поддержки начальной загрузки отображаются для 100 реплик, когда> = 70. B) Все деревья имеют средний корень.

https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007564.s016

(EPS)

Благодарности

Мы хотим поблагодарить Арианну Бабину за важную информацию о динамике глицинового рибопереключателя, Джона Энтони за фундаментальные работы по конвейерам и серверам Infernal, Дэниела Берингера и Элизабет Грей за помощь и отзывы на протяжении всего проекта, а также Саманту Дайкман и Дефне Суруджон за поддержку, корректуру и мозговой штурм на протяжении всего процесса написания.

Ссылки

  1. 1. Хоугланд М., Стивенсон М., Скотт Дж., Лизелотт Х., Замечник П.Синтез растворимых рибонуклеиновых белков промежуточных звеньев. Ribonucleic Acid Protein Synth. 1957; 231: 241–257.
  2. 2. Цукуда М., Китахара К., Миядзаки К. Сравнительный анализ функции РНК показывает высокое функциональное сходство между отдаленно родственными бактериальными 16 S рРНК. Sci Rep [Интернет]. 2017; 7 (1): 9993
  3. 3. Kruger K, Grabowski PJ, Zaug AJ, Sands J, Gottschling DE, Cech TR. Самосплайсинг РНК: автоэксцизия и автоциклизация рибосомной РНК, промежуточной последовательности тетрагимены.Клетка. 1982. 31 (1): 147–57. pmid: 6297745
  4. 4. Хатчинс С.Дж., Ратьен П.П., Форстер А.С., Саймонс Р.Х. Саморасщепление транскриптов плюс и минус РНК вироида солнечных пятен авокадо. Nucleic Acids Res. 1986. 14 (9): 3627–40. pmid: 3714492
  5. 5. Винклер WC, Breaker RR. Генетический контроль с помощью рибопереключателей, связывающих метаболит. ChemBioChem. 2003. 4 (10): 1024–32. pmid: 14523920
  6. 6. Баррик Дж. Э., Брейкер Р. Р. Распределение, механизмы и структуры рибопереключателей, связывающих метаболит.Genome Biol. 2007; 8 (11): R239. pmid: 17997835
  7. 7. Lindgreen S, Umu SU, Lai ASW, Eldai H, Liu W., McGimpsey S и др. Надежная идентификация некодирующей РНК из транскриптомов требует филогенетически обоснованной выборки. PLoS Comput Biol. 2014; 10 (10): e1003907. pmid: 25357249
  8. 8. Хёппнер М.П., ​​Гарднер П.П., Пул А.М. Сравнительный анализ семейств РНК выявляет различные репертуары для каждой области жизни. PLoS Comput Biol. 2012; 8 (11): e1002752. pmid: 23133357.
  9. 9. Стаматакис А. RAxML версия 8: Инструмент для филогенетического анализа и постанализа крупных филогенетических структур. Биоинформатика. 2014; 30 (9): 1312–3. pmid: 24451623
  10. 10. Чарльстон МиА, Хенди MD, Пенни Д. Влияние длины последовательности, топологии дерева и количества таксонов на эффективность филогенетических методов. J Comput Biol. 2009. 1 (2): 133–51. pmid: 87
  11. 11. Малик Л., Альмодареси Ф., Патро Р. Группер: кластеризация и аннотация на основе графов для улучшенного анализа транскриптомов de novo.Биоинформатика. 2018; 34 (19): 3265–72. pmid: 29746620
  12. 12. Nawrocki EP, Эдди SR. Infernal 1.1: поиск гомологии РНК в 100 раз быстрее. Биоинформатика. 2013. 29 (22): 2933–5. pmid: 24008419
  13. 13. Барквист Л., Бердж С.В., Гарднер П.П. Изучение гомологии и консервации РНК с помощью infernal: от отдельных последовательностей до семейств РНК. Curr Protoc Bioinforma. 2016; 2016: 12.13.1–12.13.25. pmid: 27322404
  14. 14. Kalvari I, Argasinska J, Quinones-Olvera N, Nawrocki EP, Rivas E, Eddy SR, et al.Rfam 13.0: переход к геному-центричному ресурсу для некодирующих семейств РНК. Nucleic Acids Res. 2018; 46 (D1): D335–42. pmid: 2

    18
  15. 15. Kalvari I, Nawrocki EP, Argasinska J, Quinones-Olvera N, Finn RD, Bateman A, et al. Анализ некодирующей РНК с использованием базы данных Rfam. Curr Protoc Bioinforma. 2018; 62 (1): e51. pmid: 29927072.
  16. 16. Mukherjee S, Das Mandal S, Gupta N, Drory-Retwitzer M, Barash D, Sengupta S. RiboD: обширная база данных по прокариотическим рибопереключателям.Биоинформатика. 2019; 35 (18): 3541–3. pmid: 30726866
  17. 17. Абреу-Гуджер С., Мерино Э. RibEx: веб-сервер для определения местоположения рибопереключателей и других консервативных бактериальных регуляторных элементов. Nucleic Acids Res. 2005; 33 (выпуск веб-сервера): W690–2. pmid: 15980564
  18. 18. Чанг ТХ, Хуанг Х-Д, Ву Л-К, Йе Ц-Т, Лю Би-Дж, Хорнг Дж-Т. Вычислительная идентификация рибопереключателей на основе консервативных функциональных последовательностей и конформаций РНК. РНК. 2009; 15: 1426–30. pmid: 19460868
  19. 19.Mukherjee S, Sengupta S. Сканер Riboswitch: эффективный веб-сервер на основе pHMM для обнаружения рибопереключателей в геномных последовательностях. Биоинформатика. 2016; 32 (5): 776–8. pmid: 26519506
  20. 20. Washietl S, Hofacker IL, Stadler PF. Быстрое и надежное предсказание некодирующих РНК. Proc Natl Acad Sci USA [Интернет]. 2005. 102 (7): 2454–9. pmid: 15665081
  21. 21. Gruber AR, Findeiß S, Washietl S, Hofacker IL, Stadler PF. RNAz 2.0: улучшенное обнаружение некодирующей РНК.Pac Symp Biocomput [Интернет]. 2010: 69–79. pmid: 19

    9
  22. 22. Heyne S, Costa F, Rose D, Backofen R. Graphclust: структурная кластеризация без выравнивания локальных вторичных структур РНК. Биоинформатика. 2012. 28 (12): 224–32. pmid: 22689765
  23. 23. Miladi M, Junge A, Costa F, Seemann SE, Havgaard JH, Gorodkin J и др. RNAscClust: кластеризация последовательностей РНК с использованием консервативных структур и мотивов на основе графов. Биоинформатика. 2017; 33 (14): 2089–96. pmid: 28334186
  24. 24.Милади М., Сохоян Э., Хоуваарт Т., Хейн С., Коста Ф, Грунинг Б. и др. GraphClust2: аннотация и обнаружение структурированных РНК с масштабируемой и доступной интегративной кластеризацией. bioRxiv [Интернет]. 2019; (19): 550335. Доступно по ссылке: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/550335v1
  25. 25. Хэвилл Дж. Т., Бхатия С., Джонсон С. М., Листы Дж. Д., Томпсон Дж. С.. Новый подход к обнаружению рибопереключателей в последовательностях ДНК. Биоинформатика. 2014. 30 (21): 3012–9. pmid: 25015992
  26. 26.Lorenz R, Bernhart SH, Siederdissen CH zu, Tafer H, Flamm C, Stadler PF и др. Пакет ViennaRNA 2.0. Алгоритмы Мол биол. 2011; 1–14.
  27. 27. Hofacker IL, Fontana W., Stadler PF, Bonhoeffer LS, Tacker M. Быстрое сворачивание и сравнение вторичных структур РНК. Химический ежемесячный. 1994; 125: 167–188.
  28. 28. Сиверс Ф., Вильм А., Дайнин Д., Гибсон Т. Дж., Карплюс К., Ли В. и др. Быстрая масштабируемая генерация высококачественного выравнивания множественных последовательностей белков с помощью Clustal Omega.Mol Syst Biol. 2011; 7: 539. pmid: 21988835.
  29. 29. Madeira F, Park Y mi, Lee J, Buso N, Gur T, Madhusoodanan N и др. API-интерфейсы инструментов поиска и анализа последовательности EMBL-EBI в 2019 году. Nucleic Acids Res. 2019; 47 (W1): W636–41. pmid: 30976793
  30. 30. Мэтьюз Д.Х., Тернер Д.Х. Dynalign: алгоритм поиска вторичной структуры, общей для двух последовательностей РНК. J Mol Biol. 2002. 317 (2): 191–203. pmid: 116
  31. 31. Харманси А.О., Шарма Дж., Мэтьюз Д.Х.Эффективное попарное предсказание структуры РНК с использованием вероятностных ограничений выравнивания в Dynalign. BMC Bioinformatics. 2007; 8: 1–21. pmid: 17445273
  32. 32. Рейтер Дж., Мэтьюз Д. Структура РНК: программное обеспечение для предсказания и анализа вторичной структуры РНК. BMC Bioinformatics. 2010; 11. pmid: 20230624
  33. 33. Сундфельд Д., Хавгаард Дж. Х., Де Мело ACMA, Городкин Дж. Foldalign 2.5: Многопоточная реализация для попарного структурного выравнивания РНК. Биоинформатика. 2016; 32 (8): 1238–40.pmid: 26704597
  34. 34. Bayegan AH, Clote P. RNAmountAlign: эффективное программное обеспечение для локального, глобального, полуглобального попарного и множественного выравнивания последовательностей / структур РНК. bioRxiv [Интернет]. 2018; (Мд): 1–22. Доступно по ссылке: http://biorxiv.org/cgi/content/short/389312v1
  35. 35. Нахви А., Баррик Дж. Э., Брейкер Р. Р.. Рибопереключатели с коферментом B12 являются широко распространенными элементами генетического контроля у прокариот. Nucleic Acids Res. 2004. 32 (1): 143–50. pmid: 14704351
  36. 36. Казанов М.Д., Витрещак А.Г., Гельфанд М.С.Численность и функциональное разнообразие рибопереключателей в микробных сообществах. BMC Genomics. 2007; 8: 1–9. pmid: 17

    9
  37. 37. Сун Э.И., Лейн С.А., Казанов М.Д., Сайер М.Х., Новичков П.С., Родионов Д.А. Сравнительная геномика метаболических возможностей регулонов, контролируемых цис-регуляторными мотивами РНК у бактерий. BMC Genomics [Интернет]. 2013; 14: 597. pmid: 24060102. Доступно по адресу: BMC Genomics
  38. 38. Маккаун П.Дж., Корбино К.А., Став С., Шерлок М.Э., Брейкер Р.Р. Разнообразие и распространение Riboswitch.РНК [Интернет]. 2017; 23 (7): 995–1011. pmid: 28396576
  39. 39. Нельсон Дж. У., Атилхо Р. М., Шерлок М. Е., Стокбридж Р. Б., Брейкер Р. Р.. Метаболизм свободного гуанидина в бактериях регулируется широко распространенным классом Riboswitch. Мол. Cell 2017; 65 (2): 220–30. pmid: 27989440
  40. 40. Витрещак А.Г., Родионов Д.А., Миронов А.А., Гельфанд М.С. Рибопереключатели: самый старый механизм регуляции экспрессии генов? Тенденции Genet. 2004. 20 (1): 44–50. pmid: 14698618
  41. 41. Выключатель RR.Рибопереключатели и мир РНК. Cold Spring Harb Perspect Biol. 2012; 4 (2): pii: e003566. pmid: 21106649.
  42. 42. Мандал М., Ли М., Баррик Дж. Э., Вайнберг З., Эмильссон Г. М., Руццо В. Л., Брейкер Р. Р.. Глицин-зависимый рибопереключатель, который использует кооперативное связывание для контроля экспрессии генов. Наука. 2004; 306: 275–9. pmid: 15472076
  43. 43. Ерш К.М., Мухаммед А., МакКаун П.Дж., Брейкер Р.Р., Штробель С.А. Синглетные глициновые рибопереключатели связывают лиганд, а также тандемные рибопереключатели. РНК [Интернет].2016; 22 (11): 1728–38. pmid: 27659053
  44. 44. Ерш К.М., Штробель С.А. Связывание лиганда тандемным глициновым рибопереключателем зависит от димеризации аптамера, но не от занятости двойного лиганда. РНА [Интернет]. 2014. 20 (11): 1775–88. pmid: 25246650
  45. 45. Бабина А.М., Леа Н.Е., Мейер М.М. Поведение тандемного глицинового рибопереключателя in vivo у Bacillus subtilis. MBio. 2017; 8 (5): pii: e01602-17. pmid: 2
  46. 31.
  47. 46. Хани А., Попп Н., Крайкемейер Б., Патендж Н.Рибопереключатель глицина в Streptococcus pyogenes контролирует экспрессию гена белка семейства натрий-аланин-симпортер. Front Microbiol [Интернет]. 2018; 20 февраля; 9: 200. pmid: 29527194
  48. 47. Шерман Э.М., Эсквиаки Дж., Эльсайед Дж., Йе Дж-Д. Энергетически выгодное взаимодействие лидер-линкер устраняет кооперативность связывания лиганда в глициновых рибопереключателях. РНА [Интернет]. 2012. 18 (3): 496–507. pmid: 22279151
  49. 48. Квон М., Штробель С.А. Химические основы кооперативности глицинового рибопереключателя.РНА [Интернет]. 2008. 14 (1): 25–34. pmid: 18042658
  50. 49. Эрион Т. В., Штробель С.А. Идентификация третичного взаимодействия, важного для кооперативного связывания лиганда глициновым рибопереключателем. РНА [Интернет]. 2011. 17 (1): 74–84. pmid: 21098652
  51. 50. Батлер Е.Б., Сюн Й., Ван Дж., Штробель С.А. Структурные основы кооперативного связывания лиганда глициновым рибосвитчем. Chem Biol. 2011; 18 (3): 293–8. pmid: 21439473
  52. 51. Кладванг В, Чжоу ФК, Дас Р.Автоматическое предсказание структуры РНК обнаруживает линкер изгиба поворота в двойных глициновых рибопереключателях. J Am Chem Soc. 2012. 134 (3): 1404–7. pmid: 22192063
  53. 52. О’Лири Н.А., Райт М.В., Бристер Дж. Р., Чиуфо С., Хаддад Д., Маквей Р. и др. База данных эталонных последовательностей (RefSeq) в NCBI: текущий статус, таксономическое расширение и функциональная аннотация. Nucleic Acids Res. 2016; 44 (D1): D733–45. pmid: 26553804
  54. 53. Вайнберг З., Нельсон Дж. У., Люнсе К.Э., Шерлок М.Э., Брейкер Р.Р. Биоинформатический анализ структур рибопереключателей позволяет выявить классы вариантов с измененной специфичностью лиганда.Proc Natl Acad Sci [Интернет]. 2017; 114 (11): E2077–85. pmid: 28265071
  55. 54. Торгерсон С.Д., Хиллер Д.А., Став С.А., Штробель С.А. Генная регуляция синглетом глицинового рибопереключателя использует точно настроенный энергетический ландшафт для спирального переключения. Рна. 2018; 24 (12): 1813–27. pmid: 30237163
  56. 55. Jäger ML. MCL: Марковский кластерный алгоритм. 2015. Пакет R версии 1.0. Доступно по ссылке: https://CRAN.R-project.org/package=MCL
  57. 56. Хенниг К. fpc: Гибкие процедуры кластеризации [Интернет].2019. Пакет R версии 2.2-3. Доступно по ссылке: https://cran.r-project.org/package=fpc
  58. 57. Баррик Дж. Э., Корбино К. А., Винклер В. К., Нахви А., Мандал М., Коллинз Дж. И др. Новые мотивы РНК предполагают расширение возможностей рибопереключателей в генетическом контроле бактерий. Proc Natl Acad Sci [Интернет]. 2004. 101 (17): 6421–6. pmid: 15096624
  59. 58. Снелл Э., Гирар М. Некоторые взаимосвязи пириксодина, аланина и глицина в их влиянии на некоторые молочнокислые бактерии.Proc Natl Acad Sci. 1943; 874 (1942): 66–73. pmid: 16588604
  60. 59. Maculla ES, Cowles PB. Использование глицина в разрушении бактериальных клеток. Наука. 1948; 107: 376–377. pmid: 17783091
  61. 60. Хисинума Ф., Изаки К., Такахаши Х. Влияние глицина и d-аминокислот на рост различных микроорганизмов. Agric Biol Chem. 1969; 33 (11): 1577–86.
  62. 61. Hammes W, Schleifer KH, Kandler O. Механизм действия глицина на биосинтез пептидогликана.J Bacteriol. 1973; 116 (2): 1029–53. pmid: 4200845
  63. 62. Тезука Т., Охниши Ю. Два глициновых рибопереключателя активируют систему расщепления глицина, необходимую для детоксикации глицина у Streptomyces griseus. J Bacteriol. 2014; 196 (7): 1369–76. pmid: 24443533
  64. 63. Атильо Р.М., Перкинс К.Р., Брейкер Р.Р. Редкие варианты класса рибопереключателей FMN у Clostridium difficile и других бактерий проявляют измененную лигандную специфичность. РНК. 2019; 25 (1): 23–34. pmid: 30287481
  65. 64.Ким Дж. Н., Рот А., Брейкер Р. Р.. Варианты рибопереключателя гуанина из Mesoplasma florum избирательно распознают 2’-дезоксигуанозин. PNAS. 2007; 104 (41).
  66. 65. Мейер М.М., Хаммонд М.С., Салинас Y, Рот А., Сударсан Н., Брейкер Р.Р. Проблемы идентификации лиганда для кандидатов на рибосвитч. RNA Biol. 2011; 8 (1): 5–10. pmid: 21317561
  67. 66. Шерлок М.Э., Сударсан Н., Брейкер Р.Р. Рибопереключатели для будильника ppGpp расширяют коллекцию сигнальных систем на основе РНК.Proc Natl Acad Sci. 2018; 115 (23): 6052–7. pmid: 29784782
  68. 67. Шерлок МЭ, Сударсан Н, Став С, Брейкер РР. Тандемные рибопереключатели образуют естественный логический вентиль для управления метаболизмом пуринов в бактериях. Элиф. 2018; 7. pii: e33908. pmid: 29504937
  69. 68. Шерлок ME, Sadeeshkumar H, Breaker RR. Варианты бактериальных рибопереключателей, ассоциированные с генами нуклеотидгидролазы, чувствительными к дифосфатам нуклеозидов. Биохимия. 2019; 58 (5): 401–10. pmid: 30081631
  70. 69.Ван Дж., Брейкер Р. Рибопереключатели, которые чувствуют S-аденозилметионин и S-аденозилгомоцистеин. Biochem Cell Biol. 2008. 86: 157–68. pmid: 18443629
  71. 70. Мирихана Араччилаге G, Шерлок ME, Вайнберг Z, Breaker RR. РНК SAM-VI избирательно связывают S-аденозилметионин и проявляют сходство с рибопереключателями SAM-III. РНК Биол [Интернет]. 2018; 15 (3): 371–8. pmid: 2

    23
  72. 71. Weickhmann AK, Keller H, Wurm JP, Strebitzer E, Juen MA, Kremser J, et al.Структура рибопереключателя, связывающего SAM / SAH. Nucleic Acids Res. 2019; 47 (5): 2654–65. pmid: 305
  73. 72. Quinlan AR. BEDTools: Инструмент швейцарской армии для анализа особенностей генома. Vol. 2014, Текущие протоколы в биоинформатике. 2014. 11.12.1–11.12.34. pmid: 25199790
  74. 73. Will S, Reiche K, Hofacker IL, Stadler PF, Backofen R. Выведение семейств и классов некодирующих РНК с помощью кластеризации на основе структуры на уровне генома. PLoS Comput Biol. 2007; 3: e65.pmid: 17432929
  75. 74. Уилл С., Джоши Т., Хофакер И.Л., Стадлер П.Ф., Бакофен Р. LocARNA-P: точное предсказание границ и улучшенное обнаружение структурированных РНК для полногеномных скринингов. Рна. 2012; 18: 900–14. pmid: 22450757
  76. 75. Раден М., Али С.М., Алькнбаши О.С., Буш А., Коста Ф., Дэвис Дж. А. и др. Инструменты РНК Фрайбурга: центральный онлайн-ресурс для исследований и обучения РНК. Nucleic Acids Res. 2018; 46 (W1): W25–9. pmid: 29788132
  77. 76. Чарди Г., Непуш Т.Программный комплекс igraph для сложных сетевых исследований. InterJournal [Интернет]. 2006; Комплекс Sy: 1695. Доступно по адресу: http://igraph.org
  78. 77. Эпскамп С., Крамер А.О., Уолдорп Л.Дж., Шмиттманн В.Д., Борсбум Д. qgraph: Сетевые визуализации отношений в психометрических данных. Программное обеспечение J Stat [Интернет]. 2012; 48 (4).
  79. 78. Гриффитс-Джонс С. РАЛИ — редактор выравнивания РНК в Emacs. Биоинформатика. 2005. 21 (2): 257–9. pmid: 15377506
  80. 79. Дарти К., Дениз А., Понти Ю.ВАРНА: Интерактивное рисование и редактирование вторичной структуры РНК. Биоинформатика. 2009. 25 (15): 1974–5. pmid: 19398448
  81. 80. Вайнберг З., Брейкер Р.Р. R2R — программное обеспечение для ускорения изображения вторичных структур эстетического консенсуса РНК. BMC Bioinformatics [Интернет]. 2011; 12 (1): 3. Доступно по ссылке: http://www.biomedcentral.com/1471-2105/12/3 pmid: 21205310

Глицин — обзор | Темы ScienceDirect

Глицин

Глицин — это аминокислота, обычно встречающаяся в белках.Он синтезируется в организме из серина, другой протеиногенной аминокислоты, естественным образом синтезируемой в клетках. Как одна из 20 наиболее распространенных аминокислот, содержащихся в белках, она выполняет множество метаболических функций, но некоторые из них также выделяются в синапсы в качестве нейромедиатора.

Уровни глицина в основном регулируются ферментативной деградацией. За расщепление глицина отвечают различные ферменты. Некоторые из этих процессов меняют метаболизм глицина и превращают аминокислоту обратно в серин.Другие ферментативные процессы превращают глицин в другие молекулы, в том числе в глоконовую кислоту.

Подобно глутамату и ГАМК, глицин присутствует в нервной системе и является важным строительным блоком для многих химических процессов. Как нейротрансмиттер, он связывается с несколькими семействами ионотропных и метаботропных рецепторов, но его основное ингибирующее действие, по-видимому, является результатом регуляции хлоридных каналов аналогично действию ГАМК. Эти эффекты в первую очередь проявляются в спинном мозге.В мозге эффекты глицина менее предсказуемы. Например, он, по-видимому, участвует в регуляции глутаматергической нейротрансмиссии на ионотропных рецепторах глутамата NMDA, которые участвуют в открытии кальциевых каналов и вызывают быструю деполяризацию постсинаптической клетки. Таким образом, глицин может быть алостерическим модулятором глутамата.

Повышение функции глицина может привести к эффектам, аналогичным усилению ГАМКергической нейротрансмиссии (утомляемость, сонливость и т. Д.). Однако, поскольку глицин, по-видимому, по-разному влияет на разные части мозга, добавление глицина также может вызывать возбуждающие эффекты.Например, при передозировке глицин вызывает смерть из-за повышенной возбудимости мозга. Добавки с глицином, по-видимому, обладают ограниченными преимуществами, хотя существуют некоторые предварительные доказательства того, что они могут быть полезны при лечении симптомов психоза (как описано в главе 11).

Ингибирование действия глицина также связано с серьезными рисками. Стрихнин является мощным антагонистом глицина и вызывает мышечные судороги и смерть от асфиксии. В меньших дозах его когда-то использовали как стимулятор.Интересно, что бикукулин является более слабым антагонистом, который, по-видимому, проявляет свое действие, противодействуя глицину и ГАМК. Таким образом, эффекты ингибирования глицина могут быть аналогичны эффектам, наблюдаемым при антагонизме передачи ГАМК.

Сегмент рынка глицина, размер, доля, мировые тенденции, 2027 г.

Обзор рынка

Мировой рынок глицина прогнозируется, что среднегодовой темп роста составит 3,9% в течение прогнозируемого периода.

Глицин, также известный как аминоуксусная кислота, имеет самый низкий молекулярный вес среди всех аминокислот.Он образует основной строительный блок белков, поэтому естественным образом содержится в различных пищевых продуктах, таких как бобы, рыба, мясо, молоко и сыр. Помимо естественного изобилия глицина, он может использоваться в широком диапазоне применений, таких как пищевые добавки, гербициды, косметика и как ароматизатор в безалкогольных напитках.

Глицин оказался жизненно важным для поддержания функционирования пищеварительной и нервной системы и продемонстрировал потенциальные терапевтические эффекты. Таким образом, можно найти множество применений в медицине.Это, вероятно, будет стимулировать мировой рынок фармацевтического сектора. Например, глицин действует как тормозящий нейротрансмиттер, предотвращающий эпилептические припадки. Он также используется для лечения муковисцидоза, доброкачественной гиперплазии предстательной железы и некоторых редких наследственных психических расстройств. Кроме того, благодаря своему сладкому вкусу, он также используется в качестве ароматизатора в безалкогольных напитках и концентратах соков в пищевой промышленности и производстве напитков, что способствует росту рынка во всем мире.

Кроме того, растущее использование глицина в различных продуктах личной гигиены, таких как антиперспиранты и косметика, также создает прибыльные возможности для игроков, работающих на мировом рынке глицина.Кроме того, ожидается, что растущее использование глицина в агрохимической промышленности и производстве кормов для животных будет стимулировать рост рынка.

Однако некоторые побочные эффекты глицина, такие как тошнота, легкое головокружение и легкое свистящее дыхание, вероятно, ограничат рост во всем мире.

Доля мирового рынка глицина по отраслям конечного использования, 2018 г. (%)

Источник: анализ MRFR

Региональный анализ

Глобальный глицин был проанализирован для пяти основных регионов — Северной Америки, Латинской Америки, Азиатско-Тихоокеанского региона, Европы, Ближнего Востока и Африки.

Азиатско-Тихоокеанский регион занимал доминирующую долю рынка в 2018 году и, как ожидается, продемонстрирует свое доминирование в течение прогнозируемого периода. Это в первую очередь связано с растущим спросом на продукт в расширяющейся отрасли конечного потребления, прежде всего в фармацевтике и продуктах питания и напитках. Китай, за которым следуют Индия и другие страны Юго-Восточной Азии, укрепляет лидирующие позиции в регионе благодаря растущему гериатрическому населению и быстрорастущей фармацевтической промышленности. Например, по данным India Brand Equity Foundation (IBEF), фармацевтический сектор Индии в 2017 году оценивался в 33 миллиарда долларов, и ожидается, что среднегодовой темп роста составит 22.4% за 2015-2020 годы; это может стимулировать спрос на глицин в фармацевтической промышленности. Более того, растущий спрос на агрохимикаты из-за наличия обширных пахотных земель в регионе еще больше способствует росту регионального рынка.

Североамериканский рынок занимал высокую долю рынка в 2018 году из-за повышенного спроса на продукт в развитых фармацевтических отраслях в регионе. США, за которыми следует Канада, являются ведущей страной из-за присутствия в регионе основных ключевых игроков, таких как Geo Specialty Chemicals, Chattem Chemicals и Ajinomoto.

Ожидается, что европейский рынок также продемонстрирует значительный рост в течение прогнозируемого периода из-за широкого использования глицина, например, в медицинских и косметических целях. Основными участниками регионального рынка являются Германия, Великобритания, Франция и Швейцария

Ожидается, что рынок глицина в Латинской Америке, на Ближнем Востоке и в Африке будет демонстрировать высокие темпы роста в течение прогнозируемого периода из-за растущей индустриализации в регионе.

Сегментация рынка глицина

Market Research Future сегментирует глобальный глицин на основе сорта, отрасли конечного использования и региона.

Рынок подразделяется на пищевой, фармацевтический и технический.

Исходя из отрасли конечного использования, глобальный рынок глицина подразделяется на продукты питания и напитки, косметику и средства личной гигиены, фармацевтические препараты, агрохимикаты и другие.

В региональном разрезе рынок охватывает пять ключевых регионов, включая Азиатско-Тихоокеанский регион, Северную Америку, Европу, Латинскую Америку, Ближний Восток и Африку.

Ключевые игроки

ШОВА ДЕНКО К.K. (Япония), Chattem Chemicals, Inc. (США), GEO Specialty Chemicals, Inc. (США), Evonik Industries AG (Германия), Ajinomoto Health & Nutrition North America, Inc. (США), AMINO GmbH (Германия), YUKI GOSEI KOGYO CO., LTD (Япония), Advance Chemical Sales Corporation (Индия), Triveni Chemicals (Индия) и Aditya Chemicals (Индия).

Целевая аудитория



  • Производители глицина

  • Торговцы и дистрибьюторы глицина

  • Научно-исследовательские институты

  • Потенциальные инвесторы

  • Поставщики сырья

  • Национальная лаборатория

Часто задаваемые вопросы (FAQ):


Глицин — это аминокислота и аминокислота с наименьшей молекулярной массой.Он поддерживает пищеварительную и нервную системы.

Рост спроса на фармацевтические добавки для устранения дефицита, вероятно, станет основным драйвером для рынка глицина.

Ожидается, что рынок глицина будет демонстрировать высокий среднегодовой темп роста 3,9% в течение прогнозируемого периода.

Фармацевтическая промышленность занимает самую большую долю на мировом рынке глицина — 39%.

Ведущим региональным рынком глицина является Азиатско-Тихоокеанский регион. Растущий фармацевтический сектор в Индии и Китае, вероятно, станет основным двигателем для рынка глицина.

Анализ тенденций мирового рынка глицина с указанием размера, доли, роста, спроса и отраслевой анализ ведущими игроками для прогноза к 2027 году

Глицин — простейшая аминокислота, которая представляет собой бесцветное кристаллическое твердое вещество со сладким вкусом.Он нерастворим в этаноле и этиловом эфире, тогда как умеренно растворим в ацетоне. Он помогает в здоровом функционировании почек и печени, поскольку естественным образом доступен в изобилии. Глицин находит применение в продуктах питания и напитках, косметике и личной гигиене, фармацевтических препаратах, промежуточных химических продуктах и ​​др. В кормах для животных и домашних животных он используется в качестве добавки, а также в качестве подсластителя и белковых напитков.

Получить образец брошюры в формате PDF о влиянии COVID19: https: // www.coherentmarketinsights.com/insight/request-sample/2886

Динамика рынка

Растущий спрос на глицин со стороны различных конечных потребителей стимулирует рост рынка. Ожидается, что растущий рынок обработанных пищевых продуктов увеличит спрос на глицин из-за растущего спроса на легкие и готовые к приготовлению продукты и фаст-фуд. Более того, ожидается, что новые концепции питания, такие как «бесплатное питание», «продукты в час пик» и другие, в ближайшем будущем повысят спрос на глицин. Ожидается, что мировое потребление продуктов животного происхождения, таких как мясо, молоко и яйца, вырастет из-за растущего спроса на продукты, богатые белком.Это, в свою очередь, увеличит спрос на глицин в кормах для животных, тем самым подпитывая рост рынка глицина.

Глицин широко используется в косметической промышленности. Следовательно, растущий спрос на косметические продукты из-за изменения образа жизни потребителей будет стимулировать рост рынка глицина. Например, было подсчитано, что в США более 30% глицина используется в качестве добавки в косметике и товарах личной гигиены, в основном в дезодорантах и ​​антиперспирантах.

Примените промокод «STAYHOME» и получите мгновенную скидку в размере 1000 долларов США
Купите сейчас этот премиальный отчет для развития своего бизнеса @ https: // www.coherentmarketinsights.com/insight/buy-now/2886

Обзор рынка

В зависимости от региона глобальный рынок глицина делится на Северную Америку, Латинскую Америку, Европу, Азиатско-Тихоокеанский регион, Ближний Восток и Африку. Северная Америка занимает доминирующее положение на мировом рынке глицина, однако в этом регионе наблюдается застойный рост с последних нескольких месяцев из-за вялого спроса. Высокий спрос на упакованные продукты питания и мясные продукты заставляет рынок в США.S лидирует в этом регионе.

Азиатско-Тихоокеанский регион является самым быстрорастущим регионом на мировом рынке глицина благодаря присутствию развивающихся экономик, таких как Индия, Япония, Китай, Сингапур и Южная Корея. Ожидается, что в течение прогнозируемого периода в Европе будет наблюдаться умеренный рост мирового рынка глицина из-за вялого роста конечных потребителей и экономического спада.

Просмотрите отчет об исследовании по адресу: https://www.coherentmarketinsights.com/ongoing-insight/glycine-market-2886

Ключевые игроки

Некоторые из основных игроков, работающих на мировом рынке глицина, включают Evonik Industries, GEO Specialty Chemicals, Inc., Showa Dekno KK и The Dow Chemical Company.

Другой эксклюзивный отчет:

Рынок монохлоруксусной кислоты (MCAA), по областям применения (производство химических соединений (карбоксиметилцеллюлоза, тиогликолевая кислота, технический глицин и другие продукты (цианоуксусная кислота, гликолевая кислота, бетаин)), лекарственные препараты (глицин класса USP, другие) (Ib , Гербициды и инсектициды (технический глицин, 2,4-D, 2,4,5-T, другие (MCPA, диметоат)) и другие (другие (индиго красители, амфотерные поверхностно-активные вещества)), по конечному применению (фармацевтические препараты). Промышленность, химическая промышленность (агрохимия, химикаты специального назначения, прочее (красители, моющие средства, полимеры, целлюлоза и бумага), пищевая промышленность, промышленность средств личной гигиены, прочее (нефть и газ)) и по регионам (Северная Америка, Латинская Америка, Европа, Азиатско-Тихоокеанский регион, Ближний Восток и Африка) — размер, доля, перспективы и анализ возможностей, 2019-2027 гг.

О нас:

Coherent Market Insights — это глобальная маркетинговая и консалтинговая организация, деятельность которой направлена ​​на оказание помощи множеству наших клиентов в достижении трансформационного роста, помогая им принимать важные бизнес-решения.У нас есть штаб-квартира в Индии, офисы в глобальной финансовой столице в США и консультанты по продажам в Великобритании и Японии. Наша клиентская база включает игроков из различных вертикалей бизнеса из более чем 150 стран мира. Мы гордимся тем, что обслуживаем клиентов по всему миру, от компаний, включенных в список Fortune 500, до некоммерческих организаций и стартапов, стремящихся закрепиться на рынке. Мы выделяемся тем, что предлагаем беспрецедентную аналитическую информацию о рынке по различным отраслям, включая химические вещества и материалы, здравоохранение, продукты питания и напитки, потребительские товары, упаковку, полупроводники, программное обеспечение и услуги, телекоммуникации и автомобилестроение.Мы предлагаем синдицированные отчеты о рыночной аналитике, индивидуальные исследовательские решения и консалтинговые услуги.

Чтобы узнать о нас больше, посетите наш веб-сайт — www.coherentmarketinsights.com

Контакт:

Coherent Market Insights
1001 4th Ave, # 3200 Seattle, WA 98154, US
Электронная почта: [email protected]
Соединенные Штаты Америки: + 1-206-701-6702
Великобритания: + 44-020-8133- 4027
Япония: + 050-5539-1737
Индия: + 91-848-285-0837

Этот контент был распространен через службу распространения пресс-релизов CDN Newswire.По вопросам пресс-релиза пишите нам по адресу [email protected]

Glycine-Pharma Grade Market анализирует производственные затраты и канал сбыта [2021-2030] | Аджиномото, Юки Госей Когио

Пуна, Махараштра, Индия, 25 ноября 2020 г. (Wiredrelease) Prudour Pvt. Ltd: Размер глобального рынка глицина-фармацевтических сортов в 2021 году будет зависеть от роста клинических испытаний в последующие годы и обеспечивает скрупулезный анализ рынка по стоимости, производственной мощности, ведущим ключевым игрокам, сортам и областям применения в регионе и т. Д. .Чтобы ускорить рост в течение этого периода времени, отчет подробно анализирует потенциальные риски и возможности, которые могут быть сосредоточены на рынке Glycine-Pharma Grade. Эта исследовательская работа предоставляет новейшие отраслевые данные и будущие тенденции, позволяя определять продукты и конечных пользователей, способствующие росту доходов и прибыльности. В отчете оцениваются ключевые возможности на рынке и выделяются факторы, которые являются и будут стимулировать рост химической промышленности и материаловедения.

Супер скидка !! Получите максимальную скидку до 25% в отчетах об исследовании рынка [Один пользователь | Многопользовательская | Корпоративные пользователи действительны до 15 января 2021 года.

Market.us — это компания, которая занимается предоставлением различных фармацевтических услуг, таких как разработка продуктов, статистический анализ и обновление нормативных требований. Тщательная оценка сдерживающих факторов, включенных в отчет, показывает контраст между драйверами и дает возможность для стратегического планирования. Отчет также предлагает поддержку обзору ведущих компаний, охватывающему их успешные маркетинговые стратегии, вклад на рынок, недавние события как в историческом, так и в настоящем контексте.

Загрузите эксклюзивный образец PDF-файла вместе с профилями нескольких компаний по адресу https://market.us/report/glycine-pharma-grade-market/request-sample/

В исследовательском отчете использовались цифры и цифры всесторонне с помощь графического и графического представления, которое представляет большую ясность на рынке. Это поможет вам найти действенные идеи и принять решения на основе данных для развития вашего бизнеса, а также оценить ограничения сильных игроков и сильные стороны известных игроков с помощью SWOT-анализа.Ключевые игроки, представленные в отчете, включают таких как Ajinomoto, Yuki Gosei Kogyo, Showa Denko KK, GEO Specialty Chemicals, Chattem Chemicals, Paras Intermediates, Evonik.

ПРИМЕЧАНИЕ. Согласно market.us, в отчете освещаются основные проблемы и опасности, с которыми компании могут столкнуться из-за беспрецедентной вспышки COVID-19.

Ключевые показатели рынка глицина и фармацевтических сортов:

Потоки доходов участников рынка на рынке глициновых фармацевтических сортов.

Статистика общего объема продаж и общей рыночной выручки.

Разбивка отраслевых тенденций.

Предполагаемый темп роста рынка.

Плюсы и минусы прямых и косвенных каналов продаж.

Исчерпывающая информация об основных дистрибьюторах, дилерах и трейдерах.

Из чего он состоит?

Разделение рынка на фармацевтические сорта глицина | по типу и по приложениям для полного и глубокого исследования и выявления профиля и перспектив рынка. Ценная информация, содержащаяся в рыночном отчете Glycine-Pharma Grade, была разделена на ключевые сегменты и подсегменты.

Сегмент по типу продукта, в этом отчете основное внимание уделяется потреблению, рыночной доле и темпам роста рынка по каждому типу продукта, и его можно разделить на 0,99, 0,995, 0,998.

Сегмент за приложением, в этом отчете основное внимание уделяется потреблению, доле на рынке и темпам роста рынка в каждом приложении, и его можно разделить на антацид, терапевтическое средство от мышечной дистрофии и антидот.

В отчете представлен всесторонний анализ региональных сегментов, охватывающих Северную Америку (США, Канада и Мексику), Европу (Германия, Франция, Великобритания, Россия и Италия), Азиатско-Тихоокеанский регион (Китай, Япония, Корея). , Индия, Юго-Восточная Азия и Австралия), Южная Америка (Бразилия, Аргентина), Ближний Восток и Африка (Саудовская Аравия, ОАЭ, Египет и Южная Африка) в глобальном отчете Glycine-Pharma Grade с масштабными разработками, прогрессивными технологиями и доходами (2021 г. -2030)

Заинтересованы в получении данных? Спросите здесь (официальные сообщения будут доставляться только с использованием проверенной корпоративной электронной почты) на https: // market.us / report / glycine-pharma-grade-market / # request

В этом исследовательском отчете вы можете найти информацию, которая поможет вам принимать обоснованные решения по следующим вопросам:

1. Каким образом продажи фиксируют замедление из-за COVID- 19 вспышка.

2. Как увеличить продажи на зарубежных рынках.

3. Как увеличить размер чистой прибыли и рассчитать смету.

4. Какие задачи помогут диверсифицировать ваш бизнес и воспользоваться новыми рыночными возможностями.

5.Новое определение роли производственных мощностей.

6. Какая процедура используется для снижения затрат на производство и цепочку поставок.

7. Как сделать вашу цепочку поставок более устойчивой.

8. Как подготовить свой бизнес к глобальному расширению.

Запрос на анализ влияния COVID-19 на инвестиционный анализ, проводимый ведущими производителями на рынке глицина и фармацевтических препаратов: https://market.us/request-covid-19/?report_id=39761

Настройка отчета:

Настоящий отчет могут быть настроены в соответствии с требованиями клиентов.Пожалуйста, свяжитесь с нашей командой (запрос@market.us), которая позаботится о том, чтобы вы получили отчет, соответствующий вашим потребностям. Вы также можете связаться с нашими руководителями по телефону + 1-718-618-4351, чтобы поделиться своими требованиями к исследованиям.

Ответы на ключевые вопросы по следующим пунктам:

Размер общего рынка глициновой фармацевтической марки и его сегментов?

Технология производства используется в Glycine-Pharma Grade

Размер рынка на региональном и национальном уровне?

Ключевые игроки рынка и их ключевые конкуренты?

Рыночная цепочка создания стоимости и ключевые тенденции, влияющие на каждый узел в отношении компаний

Стратегии роста, принятые ключевыми игроками

Ключевые сегменты и подсегменты

Ключевые драйверы, ограничения, возможности и проблемы

Привлекательные инвестиционные возможности в рамках рынок

Графики привлекательности по регионам, ценовым сегментам и каналам сбыта

В данном пресс-релизе представлены мультимедиа !! Посмотреть полную версию можно здесь: https: // market.us / report / glycine-pharma-grade-market /

Ключевые темы:

1. Предисловие [принятие решений на основе данных для развития вашего бизнеса]

1.1 Описание отчета

1.2 Методология исследования наряду с систематической разработкой исследования

1.3 Решения на основе данных для вашего бизнеса

1.4 Глоссарий и особые термины

2. Краткое изложение на основе краткого обзора рыночных показателей

2.1 Основные выводы

2.2 Тенденции рынка

3.Глобальная торговая площадка Glycine-Pharma [Поиск новых продуктов для диверсификации вашего бизнеса]

3.1 Лучшие продукты для диверсификации вашего бизнеса

3.2 Самые продаваемые продукты в мире

3.3 Самые популярные продукты в мире

3.4 Самые продаваемые продукты

3.5 Самые прибыльные Продукты для экспорта

4. Анализ пяти сил [Определение потенциальной прибыльности вашей стратегии]

4.1 Итоги пяти сил

4.2 Торговая сила покупателей

4.3 Торговая сила поставщиков

4.4 Угроза новых участников

4.5 Угроза замены

4.6 Угроза конкуренции

4.7 Состояние рынка

5. Наиболее перспективные страны-поставщики [Выбор лучших стран для создания устойчивой цепочки поставок]

5.1 Основные страны-поставщики вашей продукции

5.2 Ведущие страны-производители

5.3 Ведущие страны-экспортеры

5.4 Страны-экспортеры с низкими издержками

6.Профили стран [Крупнейшие рынки и их профили]

7. Приложение

7.1 Объем отчета

7.2 Курсы конвертации валют для

долларов США

7.3 Список сокращений

Изучите широкий охват рынка промышленных товаров Market.us

Рынок водопроводных и канализационных труб [2021–2030] Рынок: Растущий спрос на рынок водопроводных и канализационных труб [2021–2030] для значительного увеличения доходов в связи с кризисом COVID-19. Этот отчет включает в себя различный анализ сегментов, статистику, влиятельных лиц, участников рынка и бизнес-стратегии, принятые на период 2021-2030 гг.

Глобальный рынок организации воздушного движения (ОрВД) [2021-2030] Рынок: ознакомьтесь с анализом глобального рынка организации воздушного движения (ОрВД) [2021-2030] с информацией об анализе воздействия COVID-19, будущих тенденциях, развитии и сильных сторонах рынка лидеры.

Контактное лицо для СМИ

Название компании: Market.us (Powered By Prudour Pvt. Ltd.)

Контактное лицо: г-н Бенни Джонсон

Электронная почта: [email protected]

Телефон: +1 718 618 4351

Адрес: 420 Lexington Avenue, Suite 300 New York City, NY 10170, США

Блог: MedicalMarket Research Reports

Свяжитесь с нами в LinkedIn | Facebook | Twitter

Этот контент был опубликован Prudour Pvt.ООО. Отдел новостей WiredRelease не участвовал в создании этого контента. По вопросам предоставления пресс-релизов обращайтесь к нам по адресу [email protected]

Приток возможностей в сельском хозяйстве и фармацевтике

Нью-Йорк, 16 января 2020 г. (GLOBE NEWSWIRE) — Reportlinker.com объявляет о выпуске отчета «Исследование глобального рынка глицина: поток возможностей, обнаруженных в сельском хозяйстве и фармацевтике» — https: //www.reportlinker.com / p05837580 /? utm_source = GNW

В этом отчете об исследовании рынка представлены эксклюзивные факты и цифры о том, как рынок глицина будет расти в течение прогнозируемого периода.

Ключевые показатели роста рынка, такие как анализ цепочки создания стоимости и цепочки поставок, совокупный годовой темп роста (CAGR) и рост рынка в годовом исчислении (Y-o-Y), подробно объясняются в исследовании. Эта информация может помочь читателям понять количественные прогнозы развития рынка глицина в течение прогнозируемого периода.

Исследование актуально для заинтересованных сторон на рынке глицина, а также производителей, дистрибьюторов, поставщиков и инвесторов, поскольку оно может помочь им понять применимые стратегии роста на рынке глицина. Заинтересованные стороны, инвесторы, отраслевые эксперты, исследователи и журналисты, а также бизнес-исследователи на рынке глицина могут использовать информацию и статистические данные, представленные в отчете.

Отчет включает факты и цифры, относящиеся к макро-, а также микроэкономическим факторам, влияющим на рост рынка глицина.Исследование также предлагает практические идеи, основанные на будущих тенденциях на рынке глицина.

Кроме того, региональные игроки и новые участники рынка глицина также могут использовать информацию, представленную в этом отчете, для принятия деловых решений и усиления рыночной активности.

Ключевые вопросы, на которые даны ответы в отчете о рынке глицина

Ожидается, что какой регион будет занимать значительную долю рынка в течение прогнозируемого периода?
Каковы будут основные движущие факторы спроса на глицин в течение прогнозируемого периода?
Как текущие тенденции повлияют на рынок глицина?
Кто являются важными участниками рынка глицина?
Каковы важнейшие стратегии видных игроков на рынке глицина для повышения своих позиций в этом ландшафте?

Рынок глицина: методология исследования
В отчете используется эксклюзивная методология исследования, чтобы провести всестороннее исследование развития рынка глицина и сделать выводы о будущих факторах роста рынка.В этой методологии исследования вторичные и первичные исследования используются помощниками аналитиков для обеспечения точности и надежности выводов.

Вторичные ресурсы используются аналитиками во время оценки исследования рынка глицина, которые включают факты и цифры из Всемирного банка, веб-сайтов OEM, государственных веб-сайтов, официальных документов, торговых журналов, а также внешних и внутренних баз данных. Аналитики тщательно опросили нескольких отраслевых экспертов, таких как руководители продаж, менеджеры по продажам, менеджеры портфеля продуктов, старшие менеджеры, менеджеры по анализу рынка, менеджеры по маркетингу / продукции и менеджеры по производству, чтобы предоставить информативную информацию.

Исчерпывающая информация, полученная из первичных и вторичных ресурсов, подтверждена компаниями, работающими на рынке глицина, чтобы сделать прогнозы относительно перспектив роста рынка глицина более точными и надежными.
Прочтите полный отчет: https://www.reportlinker.com/p05837580/?utm_source=GNW

О Reportlinker
ReportLinker — это отмеченное наградами решение для исследования рынка. Reportlinker находит и систематизирует самые свежие отраслевые данные, чтобы вы могли мгновенно получать все необходимые исследования рынка в одном месте.

__________________________

         

Глобальный глицин для рынка кормов для животных 2020 Ключевые факторы и ограничения, региональный прогноз, кандидаты от конечных пользователей к 2025 году — Бизнес

Аналитический отчет, опубликованный MarketsandResearch.biz , озаглавленный Глобальный глицин для рынка кормов для животных 2020 по производителям, регионам, типам и применению, прогноз до 2025 года представляет собой полное исследование и подробный анализ доли рынка, размера, последних событий , и тенденции.В отчете представлена ​​надежная оценка глобального рынка глицина для кормов для животных, которая включает понимание текущей рыночной тенденции. В отчете представлен краткий анализ географических регионов и дальнейшее описание конкурентного сценария, чтобы помочь инвесторам, видным игрокам и новым участникам достичь ожидаемой доли рынка на этом рынке. Благодаря наличию этого всеобъемлющего отчета клиенты могут легко принять обоснованное решение о своих бизнес-инвестициях на рынке в течение прогнозируемого периода времени с 2020 по 2025 год.В отчете приводится сводка по каждому сегменту рынка, включая тип, конечный пользователь, приложения и регион.

ПРИМЕЧАНИЕ: Наши аналитики, отслеживающие ситуацию по всему миру, объясняют, что рынок создаст перспективу прибыльности для производителей после кризиса COVID-19. Отчет призван предоставить дополнительную иллюстрацию последнего сценария, замедления экономического роста и влияния COVID-19 на отрасль в целом.

Обзор рынка Включает:

Отчет имеет целью предоставить исчерпывающий обзор рынка, а также подробно описать компоненты рынка, такие как типы продуктов и конечных пользователей, с объяснением, какой компонент, как ожидается, значительно расширится.Он показывает критическую оценку формирующейся конкурентной среды производителей. В этом отчете освещаются предстоящие тенденции и возможности развития в каждом регионе. Такое понимание поможет понять глобальные тенденции на рынке и сформировать стратегии, которые будут реализованы в будущем. Кроме того, в отчете об исследовании представлены профили компаний некоторых ключевых игроков мировой индустрии глицина для питания животных.

СКАЧАТЬ БЕСПЛАТНЫЙ ОБРАЗЕЦ ОТЧЕТА: https: // www.marketandresearch.biz/sample-request/113190

Отчет также охватывает некоторые основные движущие факторы рынка, которые являются инициативами роста для продвижения глобального рынка. Согласно отчету, технологические тенденции, инновации, управляющие отраслью, являются некоторыми факторами, влияющими на развитие глобального рынка глицина для кормов для животных. Кроме того, в отчете тщательно оцениваются масштаб потенциала роста, рост выручки, ассортимент продукции и факторы ценообразования, связанные с рынком.

Основные игроки рынка, представленные на рынке и представленные в отчете: Ajinomoto, Shijiazhuang Donghua Jinlong Chemical, Chattem Chemicals, GEO Specialty Chemicals, FInOrIC, Showa Denko KK, Zhenxing Chemical, Yuki Gosei Kogyo, Paras Intermediates, Jinlong Chemical , Newtrend Group, Lincheng Golden Sugar Food, Hengshui Haoye Chemical, добавка Hebei Vision

Предполагается, что рынок локального типа будет ведущим сегментом развертывания на рынке в целом в течение прогнозного периода, охватывающего: Purity ≥99%, Purity 98.5% -99%

Предполагается, что Глицин для питания животных станет лидером отрасли по использованию приложений в течение прогнозируемого периода, охватывающего: Птица, домашний скот, домашние животные, прочее

В отчете подробно рассматриваются рынки различных регионов, которые включают: Северная Америка (США, Канада и Мексика), Европа (Германия, Франция, Великобритания, Россия и Италия), Азиатско-Тихоокеанский регион (Китай, Япония, Корея, Индия). и Юго-Восточная Азия), Южная Америка (Бразилия, Аргентина и др.)), Ближний Восток и Африка (Саудовская Аравия, Египет, Нигерия и Южная Африка)

ДОСТУП К ПОЛНОМУ ОТЧЕТУ: https://www.marketsandresearch.biz/report/113190/global-glycine-for-animal-nutrition-market-2020-by-manufacturers-regions-type-and-application-forecast-to-2025

Основное внимание в отчете о мировом рынке:

  • Первичные и вторичные ресурсы используются для сбора данных о глобальном рынке Глицина для кормов для животных, отраслевые значения, включенные в отчет, проверены отраслевыми экспертами.
  • В отчете содержится важная информация, касающаяся исследования мирового рынка, а также предстоящий рост и перспективы.
  • Основная цель отчета — выявить факторы роста рынка и угроз, которые сосредоточены на различных мероприятиях по улучшению, происходящих на рынке.
  • Отчет анализирует сегменты рынка и дает перспективный взгляд на глобальные инвестиционные регионы рынка Глицина для кормов для животных.

Кроме того, в отчете содержится исследование покупателей на рынках сбыта и сбыта, поставщиков сырья и каналов сбыта.Исследование охватывает недавнее технико-экономическое обоснование инвестиционного проекта на мировом рынке глицина для животных и описывает техническую осуществимость проекта, ожидаемую стоимость проекта и будет ли оно выгодным или нет. Рынок оценивается по сегментам, странам и производителям с процентной выручкой и продажами по ключевым странам в уважаемых регионах.

Настройка отчета:

Этот отчет можно настроить в соответствии с требованиями клиента.Пожалуйста, свяжитесь с нашим отделом продаж ([email protected]), который позаботится о том, чтобы вы получили отчет, соответствующий вашим потребностям. Вы также можете связаться с нашими руководителями по телефону + 1-201-465-4211, чтобы поделиться своими исследовательскими требованиями.

О нас

Marketsandresearch.

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *